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qPCR Regresión

Curva estándar qPCR | eficiencia, R² e incógnitas

Construye una curva estándar a partir de Cantidad (número de copias o concentración) y Ct, calcula la pendiente, la intersección, R² y la eficiencia PCR (%). Calcula cantidades desconocidas con gráficos residuales, bandas del 95 %, registros de pasos, CSV/LaTeX y comparte URL.

Todos los cálculos se ejecutan en tu navegador; los datos no se envían. Uso para investigación/educación.

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Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Pega puntos estándar (Cantidad, Ct) o carga un archivo CSV. Las filas con la misma cantidad se tratan como réplicas.
  2. Elige un método de regresión (OLS/WLS) y opciones como bandas del 95%. Ingresa valores Ct desconocidos si los tiene.
  3. Haz clic en Calcular para ver la curva estándar, la eficiencia, las comprobaciones de control de calidad, las estimaciones desconocidas y el registro de pasos. Las URL compartidas mantienen la misma configuración.

Orden recomendado

  1. Primero, construye una curva estándar. (esta página)
  2. A continuación, revisa la eficiencia de PCR (%)Saltar a la eficiencia
  3. Si es necesario, calcula la expresión relativa (ΔCt / ΔΔCt)ΔCt / ΔΔCt

ir más profundo

Entrada de datos y opciones

Los valores predeterminados son ejemplos. La selección de un valor preestablecido reemplaza los datos y configuraciones estándar/desconocidos. Para tus propios datos, pégalos y haz clic en Calcular (o Restablecer). Saltar a resultados

Consejos de ponderación WLS

WLS se ajusta con pesos puntuales. 1/Q y 1/Q² aumentar la influencia de los puntos de baja cantidad. Usa el w columna para establecer pesos por punto.

Resultados (resumen)

PCR eficiencia (%)

Calculado a partir de la pendiente m como Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100. El rango mostrado es una guía.

Los resultados iniciales usan la curva estándar de ejemplo; pega tus datos y calcula para actualizarlos.

n (puntos)15
k (niveles)5
pendiente m-3.32
intercepto b38.24
1
eficiencia (%)100.1

Los rangos son guías. Para investigación/educación, revisen juntos los puntos estándar y los residuales.

Controles de calidad (guía)

Eficiencia (guía: 90-110%)
100.1%Dentro de la guía
Eficiencia = (10^(-1/m) - 1) × 100
Pendiente (guía: -3.6 a -3.1)
-3.32Dentro de la guía
Ideal cerca de -3.32
R² (guía: > 0.98)
1Dentro de la guía
Guía de linealidad
SD de réplicas (guía: ≤ 0.5 Ct)
0/5 / 0.03 CtDentro de la guía
0 de 5 niveles fuera de rango; SD máxima 0.03 Ct
Serie de dilución ΔCt (D=10)
3.3219 / 0.0019Dentro de la guía
Esperado 3.3219; diferencia máxima 0.0019

Niveles de concentración (media ± DE)

Cantidad log10Q n Ct_media Ct_SD
1e+773150.03
1e+66318.320.03
1000005321.640.03
100004324.960.03
10003328.280.03

Puntos estándar (filas ajustadas)

Las columnas avanzadas (peso / yhat / residual / apalancamiento / cooksD) se pueden alternar.

Cantidad log10Q CT peso ŷ residual influencia D de Cook
1e+7714.97115-0.030.20.203125
1e+771511500.20
1e+7715.031150.030.20.203125
1e+6618.29118.32-0.030.10.080247
1e+6618.32118.3200.10

Muestras desconocidas (Ct → Cantidad)

muestra CT log10Q estimado Cantidad estimada DF Cantidad_corregida
U1205.493976311871.6541311871.654
U223.54.43975927527.0097127527.0097

Curva estándar y residuos

Curva estándar (Ct vs log10(Cantidad))
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Pase el cursor sobre los puntos para ver los detalles.
Ct residual frente a previsto
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Pasos de cálculo (Cómo se calcula)

    Notas para educadores

    Preguntas frecuentes

    ¿Qué es una curva estándar qPCR?

    Una curva que relaciona la cantidad estándar (número de copias o concentración) con Ct ajustando Ct frente a log10 (cantidad). Ayuda a comprobar la linealidad (R²) y la eficiencia de amplificación.

    ¿Cuántos puntos estándar se requieren?

    Se requieren al menos dos puntos para ajustar una línea. Para comprobaciones de linealidad y valores atípicos, se recomiendan entre 4 y 6 puntos.

    ¿Cómo se calcula la eficiencia (%) de PCR?

    Desde la pendiente m: Eficiencia = (10^(-1/m) - 1) × 100. El rango mostrado es una guía.

    ¿Qué indica una pendiente de alrededor de -3,32?

    Para una serie de diluciones de 10×, una pendiente cercana a -3,32 corresponde a una eficiencia aparente de aproximadamente el 100% (guía ideal).

    ¿Puede la eficiencia superar el 100%?

    Como se infiere a partir de la pendiente, pueden aparecer valores superiores al 100% por errores de dilución o inhibición. Trátalo como una guía y comprueba los residuos y los puntos estándar.

    ¿El enlace para compartir incluye datos?

    Sólo se guardan las configuraciones (métodos y opciones de banda). No se incluyen datos estándar y desconocidos.

    ¿Qué unidad debo usar para la cantidad?

    Cualquier unidad está bien (número de copias, ng, concentración). La cantidad debe ser positiva para log10.

    Referencias (notas)

    Las guías que se muestran en esta página son referencias generales. Para investigación/educación, consulta fuentes primarias según sea necesario.

    Comentarios

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