← Biología

qPCR Normalización

Calculadora ΔCt / ΔΔCt (expresión relativa)

Pega valores Ct de qPCR para calcular ΔCt, ΔΔCt y expresión relativa. Admite calibrador, genes de referencia, corrección Pfaffl, gráficos, CSV y LaTeX.

Todos los cálculos se ejecutan en su navegador; Los datos no se envían. Sólo para uso en investigación/educación. No para diagnóstico.

Otros idiomas 日本語 | English | 简体中文 | 繁體中文 | Español | Português (Brasil) | Bahasa Indonesia | Français | हिन्दी | العربية

Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Pegue datos (Grupo, Muestra, Ct objetivo, Ct referencia) o cargue un CSV. Para referencias múltiples, utilice Ct ref1, Ct ref2, ...
  2. Seleccione un grupo de calibradores (o muestra) y un método de resumen (media/mediana). Habilite la corrección Pfaffl si es necesario.
  3. Haga clic en Calcular para mostrar ΔCt/ΔΔCt, log2FC y plegar tablas y gráficos. Las URL compartidas mantienen la misma configuración.

Orden recomendado

  1. Primero, verifique la eficiencia con una curva estándar.qPCR curva estándar
  2. A continuación, calcule ΔCt / ΔΔCt (esta página)
  3. Si es necesario, evalúe la variabilidad o la importancia.Intervalos de confianza y pruebas de hipótesis.

ir más profundo

Entrada de datos y opciones

Los valores predeterminados son ejemplos. Al seleccionar un ajuste preestablecido se actualizan las entradas y configuraciones inmediatamente. Para sus propios datos, pegue y haga clic en Calcular.

Resultados (resumen)

Los datos de ejemplo ya están cargados. Con JavaScript activado, este resumen se actualiza con ΔCt, ΔΔCt, log2FC y cambio de pliegue.

Resultados por fila

Fila grupo muestra Ct_objetivo ct_ref ΔCt ΔΔCt log2FC doblar valor atípico

Los valores atípicos no se eliminan automáticamente; se muestran como candidatos (basados ​​en IQR).

Resumen del grupo

grupo norte media log2FC registro2FC SD log2FC SEM doblar la media geométrica multiplicar la media aritmética

Gráficos (log2FC/fold)

Pasos de cálculo (Cómo se calcula)

    Preguntas frecuentes

    ¿Cuál es la diferencia entre ΔCt y ΔΔCt?

    ΔCt es la diferencia dentro de la muestra entre el objetivo y la referencia. ΔΔCt es la diferencia relativa a un calibrador.

    ¿Cuál es el supuesto para 2^-ΔΔCt?

    Generalmente se supone que las eficiencias de amplificación objetivo y de referencia son iguales o similares. Utilice la corrección Pfaffl si difieren.

    ¿Debo usar fold o log2FC?

    log2FC es simétrico y más fácil para estadísticas y gráficos. Fold es más intuitivo.

    ¿Cómo se manejan múltiples genes de referencia?

    Cuando se proporcionan Ct ref1, Ct ref2, etc., los valores de Ct de referencia se agregan antes de calcular ΔCt.

    ¿Cuándo debo utilizar la corrección de eficiencia Pfaffl?

    Considere la corrección Pfaffl cuando las eficiencias objetivo y de referencia difieran sustancialmente.

    ¿El recurso compartido URL incluye datos?

    Sólo se guardan las configuraciones; los datos no están incluidos.

    Referencias (notas)

    Los supuestos y guías de esta página son referencias generales. Para investigación/educación, consulte fuentes primarias según sea necesario.

    Comentarios

    Comparta preguntas o mejoras (los comentarios se cargan después de hacer clic en el botón).