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qPCR Normalización

Calculadora ΔCt / ΔΔCt (expresión relativa)

Pega valores Ct de qPCR para calcular ΔCt, ΔΔCt y expresión relativa. Admite calibrador, genes de referencia, corrección Pfaffl, gráficos, CSV y LaTeX.

Todos los cálculos se ejecutan en tu navegador; los datos no se envían. Sólo para uso en investigación/educación. No para diagnóstico.

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Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Pega datos (Grupo, Muestra, Ct objetivo, Ct referencia) o carga un CSV. Para referencias múltiples, usa Ct ref1, Ct ref2, ...
  2. Selecciona un grupo de calibradores (o muestra) y un método de resumen (media/mediana). Habilite la corrección Pfaffl si es necesario.
  3. Haz clic en Calcular para mostrar ΔCt/ΔΔCt, log2FC y plegar tablas y gráficos. Las URL compartidas mantienen la misma configuración.

Orden recomendado

  1. Primero, comprueba la eficiencia con una curva estándar.qPCR curva estándar
  2. A continuación, calcula ΔCt / ΔΔCt (esta página)
  3. Si es necesario, evalúe la variabilidad o la importancia.Intervalos de confianza y pruebas de hipótesis.

ir más profundo

Entrada de datos y opciones

Los valores predeterminados son ejemplos. Al seleccionar un ajuste preestablecido se actualizan las entradas y configuraciones inmediatamente. Para tus propios datos, pega y haz clic en Calcular.

Resultados (resumen)

Los datos de ejemplo ya están cargados. Con JavaScript activado, este resumen se actualiza con ΔCt, ΔΔCt, log2FC y cambio de pliegue.

Resultados por fila

Fila grupo muestra Ct_objetivo ct_ref ΔCt ΔΔCt log2FC doblar valor atípico

Los valores atípicos no se eliminan automáticamente; se muestran como candidatos (basados ​​en IQR).

Resumen del grupo

grupo n media log2FC log2FC SD log2FC SEM media geométrica fold media aritmética fold

Gráficos (log2FC/fold)

Pasos de cálculo (Cómo se calcula)

    Preguntas frecuentes

    ¿Cuál es la diferencia entre ΔCt y ΔΔCt?

    ΔCt es la diferencia dentro de la muestra entre el objetivo y la referencia. ΔΔCt es la diferencia relativa a un calibrador.

    ¿Cuál es el supuesto para 2^-ΔΔCt?

    Generalmente se supone que las eficiencias de amplificación objetivo y de referencia son iguales o similares. Usa la corrección Pfaffl si difieren.

    ¿Debo usar fold o log2FC?

    log2FC es simétrico y más fácil para estadísticas y gráficos. Fold es más intuitivo.

    ¿Cómo se manejan múltiples genes de referencia?

    Cuando se proporcionan Ct ref1, Ct ref2, etc., los valores de Ct de referencia se agregan antes de calcular ΔCt.

    ¿Cuándo debo utilizar la corrección de eficiencia Pfaffl?

    Considera la corrección Pfaffl cuando las eficiencias objetivo y de referencia difieran sustancialmente.

    ¿El enlace para compartir incluye datos?

    Sólo se guardan las configuraciones; los datos no están incluidos.

    Referencias (notas)

    Los supuestos y guías de esta página son referencias generales. Para investigación/educación, consulta fuentes primarias según sea necesario.

    Comentarios

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