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biología molecular clonación

Calculadora de relación molar de ligadura (vector:inserto)

Calcula la masa de inserción requerida (ng) a partir de la masa y la longitud del vector más una relación molar objetivo (por ejemplo, 1:3). Si se conoce la concentración, también se muestra el volumen requerido (μL).

Todos los cálculos se ejecutan en tu navegador. No se envían datos.

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Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Selecciona un ejemplo o ingresa la longitud del vector (pb) y la longitud del inserto (pb).
  2. Introduce la relación molar objetivo (por ejemplo, 1:3) y la masa del vector (ng).
  3. Se muestran la masa del inserto requerida (ng) y el volumen (μL) (si se proporciona la concentración).

Esta es una calculadora de cantidades. Las proporciones óptimas dependen del tipo de extremo y de las condiciones. Sigue tu protocolo.

Entradas (vector/inserción)

—

Relación personalizada
Concentraciones (opcional: habilita el volumen requerido en μL)
Configuración avanzada

Para dsDNA, la guía predeterminada usa 660 g/mol/pb. En el cálculo de masa del inserto, el factor casi se cancela, así que el resultado depende sobre todo de la proporción de pb y de la masa.

Resultados

Cantidad requerida del inserto
— ng
Volumen requerido del inserto (si se proporciona concentración)
— μL
Volumen requerido del vector (si se proporciona concentración)
— μL
Moles (guía)
—
Relación real (inserto/vector)
—
Vector
— ng
Inserto
— ng
El enlace para compartir restaura los valores en esta página.
Comparar proporciones comunes (opcional)
Relación (vector:inserto) Cantidad del inserto (ng) Volumen del inserto (μL)

Esta herramienta calcula cantidades únicamente. No garantiza el éxito.

Cómo se calcula

  1. Como una aproximación de dsDNA, pmol = (masa_ng × 1000) / (pb × 660).
  2. Calcula el pmol del vector a partir de la masa y la longitud del vector.
  3. pmol objetivo del inserto = pmol del vector × relación objetivo; luego se convierte nuevamente a masa (ng).
  4. Si se conoce la concentración, volumen = masa/concentración.

Los valores son guías. Sigue tu protocolo para las condiciones finales.

Preguntas frecuentes

¿Por qué utilizar proporciones molares?
Los fragmentos de diferentes longitudes tienen diferentes recuentos de moléculas con la misma masa. Las proporciones molares mantienen constante el recuento de moléculas.
¿Qué proporciones se usan comúnmente?
Las proporciones de vector:inserto como 1:3 o 1:5 son puntos de partida comunes. Las proporciones óptimas dependen del tipo de extremo y de las condiciones.
¿Qué longitud de vector debo usar?
Usa la longitud real del fragmento de vector linealizado utilizado para la ligadura, a menudo la longitud completa del plásmido.
No sé la concentración del inserto.
Aún puedes calcular la masa requerida (ng). El volumen (μL) se muestra solo cuando se proporciona la concentración.
Mis volúmenes son extremadamente pequeños (por ejemplo, 0,1 µL).
Los volúmenes muy pequeños son propensos a errores. Considera una dilución intermedia o ajusta la masa del vector y el volumen de reacción.
¿Estas cantidades garantizarán el éxito?
No. Esta herramienta solo calcula cantidades. El éxito depende del tipo de extremo, las condiciones de reacción y la calidad de DNA.