使い方（3ステップ）
- 標準点（Quantity, Ct）を貼り付けるか CSV を読み込みます（同じ Quantity を複数行入れると反復として扱えます）。
- 推定法（OLS/WLS）や 95%帯などのオプションを選びます。未知試料の Ct があれば下に入力します。
- 「計算」を押すと、標準曲線・効率・品質チェック・未知量の推定・計算手順が表示されます。共有URLで同じ設定を共有できます。
おすすめの順番
- （まず）標準曲線を作る（このページ）
- （次に）PCR効率（%）を見る → 効率へ
- （必要なら）相対発現（ΔCt / ΔΔCt）を計算する → ΔCt / ΔΔCt
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データ入力とオプション
結果（サマリ）
PCR効率（%）
標準曲線の傾き m から Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100 で計算します。ここで示す範囲は目安です。
初期表示ではプリセットの標準曲線を使います。自分のデータを貼り付けて計算すると結果が更新されます。
| 点数 n | 15 |
|---|---|
| 濃度レベル数 k | 5 |
| slope m | -3.32 |
| intercept b | 38.24 |
| R² | 1 |
| efficiency (%) | 100.1 |
表示の基準は「目安」です。研究/教育用途で、標準点や残差と合わせて確認してください。
品質チェック（目安）
濃度レベル（平均±SD）
| Quantity | log10Q | n | Ct_mean | Ct_SD |
|---|---|---|---|---|
| 1e+7 | 7 | 3 | 15 | 0.03 |
| 1e+6 | 6 | 3 | 18.32 | 0.03 |
| 100000 | 5 | 3 | 21.64 | 0.03 |
| 10000 | 4 | 3 | 24.96 | 0.03 |
| 1000 | 3 | 3 | 28.28 | 0.03 |
標準点（回帰に使った点）
詳細列（weight / yhat / residual / leverage / cooksD）は折りたたみ表示できます。
| Quantity | log10Q | Ct | weight | yhat | residual | leverage | cooksD |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1e+7 | 7 | 14.97 | 1 | 15 | -0.03 | 0.2 | 0.203125 |
| 1e+7 | 7 | 15 | 1 | 15 | 0 | 0.2 | 0 |
| 1e+7 | 7 | 15.03 | 1 | 15 | 0.03 | 0.2 | 0.203125 |
| 1e+6 | 6 | 18.29 | 1 | 18.32 | -0.03 | 0.1 | 0.080247 |
| 1e+6 | 6 | 18.32 | 1 | 18.32 | 0 | 0.1 | 0 |
未知試料（Ct → Quantity）
| Sample | Ct | log10Q_hat | Quantity_hat | DF | Quantity_corrected |
|---|---|---|---|---|---|
| U1 | 20 | 5.493976 | 311871.654 | 1 | 311871.654 |
| U2 | 23.5 | 4.439759 | 27527.0097 | 1 | 27527.0097 |
標準曲線と残差図
計算の流れ
教師向けメモ
- OLS/WLS、切片あり/なしを切り替えると、傾き・残差・品質チェックがどう変わるかを比較できます。
- 反復がある場合、濃度ごとの平均とSDを見ると「ばらつき」「外れ値」「重み付け」の話に繋げやすくなります。
FAQ
qPCRの標準曲線とは何ですか？
標準試料の量（コピー数/濃度など）とCtの関係を直線（Ct vs log10(量)）で近似し、線形性（R²）や増幅効率の目安を確認するための曲線です。
標準点は何点必要ですか？
直線を引くには最低2点が必要です。線形性や外れ値を確認する目的では複数点（例: 4〜6点）を推奨します。
PCR効率（%）はどのように計算しますか？
標準曲線の傾き m から Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100 で計算します。ここで示す範囲は「目安」です。
slope が -3.32 付近だと何が分かりますか？
一般に、10倍系列の標準曲線で slope が -3.32 付近だと、見かけの増幅効率が約100%に近い目安になります（理想状態の近似）。
効率（%）が100%を超えることはありますか？
傾きから推定する指標のため、希釈誤差や阻害などの影響で100%を超える見かけの値が出ることがあります。ここでは「目安」として扱い、残差や標準点を合わせて確認してください。
共有URLにはデータも含まれますか？
推定法や帯の設定など「設定」のみを保存します。標準点や未知試料のデータ本体は含まれません。
Quantity の単位は何を入れればいいですか？
コピー数、ng、濃度など任意です。Quantity は正の数である必要があります（log10 を取るため）。
関連ツール
参考（出典メモ）
ページ内の「目安」は一般的なガイドの例です。研究/教育用途として、必要に応じて一次情報も参照してください。
コメント
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