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生物化學 曲線擬合

解離常數計算機:結合曲線擬合

根據結合資料估計 Kd(解離常數)。擬合一個位點(標準)或 Hill(協作性),比較模型 (AICc),顯示平均值±SD 和殘差,並根據需要排除異常值。

本頁僅供教育與研究輔助用途,不能取代正式實驗設計、統計審查、臨床判讀或安全規範。

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範例(預設)

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描述
使用方法(3步)
  1. 貼上濃度和響應(支援複本欄)或匯入 CSV/TSV 檔案。
  2. 選擇模型(自動/單站點/Hill)和單位。
  3. 顯示 Kd、擬合曲線和擬合指標。

這是一個分析工具。不同軟件的模型定義可能有所不同,因此請檢查工作流程中使用的方程式和 Kd 定義(50% 點)。

輸入(貼上/CSV)

格式:col 1 = 濃度,col 2+ = 響應(rep1、rep2、...)。支援 TSV/CSV。

點排除(可選)
點選繪圖上的點以排除/恢復(可撤消)
排除
行動

設定(最少需要)

高級(可選)

如果包含 0 濃度,則無法在 log10 軸上繪製它。該工具會在需要時切換顯示(例如符號日誌)。

結果

Kd(50% 點)
pKd (M)
型號
積分
均方根誤差
AIC / AICc / BIC / /
Bmax(頂部−底部)
Hill n(僅限 Hill)
型號比較(自動)

地塊

點選要排除/恢復的點(可撤消)

表(平均值±SD,預測,殘差)

濃度 意思是 標清 y_hat 殘渣 排除

參數

項目 估計 95% CI(啟用時)

95% CI 是近似值(線性化)。當您的點很少或異常值時,不要過度信任它。

一個站點 / Hill 和 Kd(50% 分)

該工具使用單位點(標準)或 Hill(協同性)模型擬合結合曲線,並將與頂部和底部之間的中點(50% 點)相對應的濃度報告為 Kd。

擬合使用 Levenberg–Marquardt(非線性最小二乘法)。啟用 SD 加權後,每個點按 1/SD 加權2.

方程(參考)

在這裡,專注 x ≥ 0。

  • 一個站點(朗繆爾): y = bottom + (top-bottom) * x / (Kd + x)
  • Hill: y = bottom + (top-bottom) * x^n / (Kd^n + x^n)(n>0)

有了這個定義, x = Kd 對應於 50% 點(頂部和底部之間的中點)。

如果包含 0 濃度(對照),則無法在 log10 軸上繪製 0,因此該工具會調整顯示(例如 symlog)。

常見問題

什麼是 Kd (解離常數)?
在此工具中,Kd 定義為與結合曲線的 50% 點(頂部和底部之間的中點)相對應的濃度。較小的 Kd 通常被解釋為較高的親和力。
一個站點和 Hill 有什麼區別?
一個站點假設標準的可飽和綁定,但沒有協作性。 Hill 模型可以捕獲協同性,並且當 Hill 係數 n 偏離 1 時非常有用。
自動模型選擇是如何工作的?
該工具適用於一個站點和 Hill,並比較 AICc 等指標。如果差異很小,則首選更簡單的單點模型通常更安全(如結果所示)。
我可以添加零濃度(對照)嗎?
是的。擬合可以處理它,但無法在對數 x 軸上繪製 0,因此該工具會在需要時調整顯示(例如符號日誌)。
重複資料如何處理?
預設情況下,擬合使用每個濃度的平均值。 SD 用於誤差線,您可以選擇按 1/SD² 加權點。
My Hill coefficient is extreme.可以嗎?
當點較少、濃度範圍較窄或異常值時,它可能會變得不穩定。考慮排除點、擴大範圍或使用約束。
pKd 是如何計算的?
如果您的 x 單位可以轉換為摩爾 (M),則 pKd = -log10(Kd[M])。對於品質濃度單位(例如 ng/mL),如果分子量已知,則可以進行轉換。