範例(預設)
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描述
—
使用方法(3步)
- 貼上濃度和響應(支援複本欄)或匯入 CSV/TSV 檔案。
- 選擇模型(自動/單站點/Hill)和單位。
- 顯示 Kd、擬合曲線和擬合指標。
這是一個分析工具。不同軟件的模型定義可能有所不同,因此請檢查工作流程中使用的方程式和 Kd 定義(50% 點)。
輸入(貼上/CSV)
格式:col 1 = 濃度,col 2+ = 響應(rep1、rep2、...)。支援 TSV/CSV。
點排除(可選)
點選繪圖上的點以排除/恢復(可撤消)
排除
—
行動
設定(最少需要)
結果
Kd(50% 點)
—
pKd (M)
—
型號—
積分—
R²—
均方根誤差—
AIC / AICc / BIC— / — / —
Bmax(頂部−底部)—
Hill n(僅限 Hill)—
型號比較(自動)—
地塊
表(平均值±SD,預測,殘差)
| 濃度 | 意思是 | 標清 | y_hat | 殘渣 | 排除 |
|---|
參數
| 項目 | 估計 | 95% CI(啟用時) |
|---|
95% CI 是近似值(線性化)。當您的點很少或異常值時,不要過度信任它。
一個站點 / Hill 和 Kd(50% 分)
該工具使用單位點(標準)或 Hill(協同性)模型擬合結合曲線,並將與頂部和底部之間的中點(50% 點)相對應的濃度報告為 Kd。
擬合使用 Levenberg–Marquardt(非線性最小二乘法)。啟用 SD 加權後,每個點按 1/SD 加權2.
方程(參考)
在這裡,專注 x ≥ 0。
- 一個站點(朗繆爾):
y = bottom + (top-bottom) * x / (Kd + x) - Hill:
y = bottom + (top-bottom) * x^n / (Kd^n + x^n)(n>0)
有了這個定義, x = Kd 對應於 50% 點(頂部和底部之間的中點)。
如果包含 0 濃度(對照),則無法在 log10 軸上繪製 0,因此該工具會調整顯示(例如 symlog)。
常見問題
什麼是 Kd (解離常數)?
在此工具中,Kd 定義為與結合曲線的 50% 點(頂部和底部之間的中點)相對應的濃度。較小的 Kd 通常被解釋為較高的親和力。
一個站點和 Hill 有什麼區別?
一個站點假設標準的可飽和綁定,但沒有協作性。 Hill 模型可以捕獲協同性,並且當 Hill 係數 n 偏離 1 時非常有用。
自動模型選擇是如何工作的?
該工具適用於一個站點和 Hill,並比較 AICc 等指標。如果差異很小,則首選更簡單的單點模型通常更安全(如結果所示)。
我可以添加零濃度(對照)嗎?
是的。擬合可以處理它,但無法在對數 x 軸上繪製 0,因此該工具會在需要時調整顯示(例如符號日誌)。
重複資料如何處理?
預設情況下,擬合使用每個濃度的平均值。 SD 用於誤差線,您可以選擇按 1/SD² 加權點。
My Hill coefficient is extreme.可以嗎?
當點較少、濃度範圍較窄或異常值時,它可能會變得不穩定。考慮排除點、擴大範圍或使用約束。
pKd 是如何計算的?
如果您的 x 單位可以轉換為摩爾 (M),則 pKd = -log10(Kd[M])。對於品質濃度單位(例如 ng/mL),如果分子量已知,則可以進行轉換。
相關工具
- 也想要劑量反應嗎? → IC50/EC50
- From signal to concentration → 蛋白質標準曲線 / ELISA 標準曲線
- 類似配件 → Michaelis-Menten 擬合器(Km、Vmax)