使用方法(3步)
- 選擇一個範例或輸入引物序列(正向/反向)。
- 如果需要,調整方法和條件(Na+、引物濃度)。
- 顯示了 Tm 和退火溫度指南 (Ta)。
Tm 和 Ta 是嚮導。最終條件取決於試劑、儀器和模板質量;如果需要,使用梯度 PCR 進行優化。
輸入(引物序列)
結果(Tm / Ta 指南)
使用方法
—
| 引物 | 溫度 | 長度 | 氣相色譜% |
|---|---|---|---|
| 前進 | — | — | — |
| 反向 | — | — | — |
ΔTm
—
塔(導遊)
—
搜尋範圍(Ta±3°C)
—
方法比較(參考)
| 引物 | 最近鄰 | 鹽調節 | 華萊士 |
|---|
當存在 IUPAC 基(N/R/Y 等)時,不應用最近鄰。
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計算方法
- 推薦(最近鄰):總結二核苷酸熱力學 (ΔH/ΔS) 並應用 Na+ 校正和引物濃度。
- 基本(鹽調節):根據 GC%、長度和 Na+ 估算 Tm。
- 很簡單(華萊士):根據 A/T 和 G/C 計數進行粗略估計(最適合短寡核苷酸)。
- 塔(導遊):較低的 Tm 減去偏移量(預設 3°C),加上建議範圍 (Ta ± 3°C)。
如果存在 IUPAC 基(N/R/Y 等),則不應用最近鄰法並使用簡單方法。
常見問題
什麼是Tm(熔化溫度)?
Tm 是大約一半 DNA 雙鏈體變性的溫度。它取決於長度、GC% 和鹽條件。
退火溫度應該如何選擇?
該工具顯示 Ta(較低的 Tm 減去偏移量)作為指導。需要時使用梯度 PCR 進行優化。
為什麼有多個公式?
不同的公式做出不同的假設。最近鄰更詳細;簡單的公式和華萊士可以快速估算。
鹽濃度會影響Tm嗎?
是的。較高的鹽通常可以穩定雙鏈體並提高 Tm。
如果正向/反向 Tm 相差很大怎麼辦?
大的 ΔTm 表明更寬的溫度範圍(梯度 PCR)或重新設計引物。
我的序列被髮送到任何地方嗎?
不會。所有計算都在你的瀏覽器中執行,並且不會發送任何資料。
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