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qPCR Regresión

qPCR calculadora de curva estándar (eficiencia, R², incógnitas)

Construya una curva estándar a partir de Cantidad (número de copias o concentración) y Ct, calcule la pendiente, la intersección, R² y la eficiencia PCR (%). Calcule cantidades desconocidas con gráficos residuales, bandas del 95 %, registros de pasos, CSV/LaTeX y comparta URL.

Todos los cálculos se ejecutan en su navegador; Los datos no se envían. Uso para investigación/educación.

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Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Pegue puntos estándar (Cantidad, Ct) o cargue un archivo CSV. Las filas con la misma cantidad se tratan como réplicas.
  2. Elija un método de regresión (OLS/WLS) y opciones como bandas del 95%. Ingrese valores Ct desconocidos si los tiene.
  3. Haga clic en Calcular para ver la curva estándar, la eficiencia, las comprobaciones de control de calidad, las estimaciones desconocidas y el registro de pasos. Las URL compartidas mantienen la misma configuración.

Orden recomendado

  1. Primero, construye una curva estándar. (esta página)
  2. A continuación, revise la eficiencia de PCR (%)Saltar a la eficiencia
  3. Si es necesario, calcule la expresión relativa (ΔCt / ΔΔCt)ΔCt / ΔΔCt

ir más profundo

Entrada de datos y opciones

Los valores predeterminados son ejemplos. La selección de un valor preestablecido reemplaza los datos y configuraciones estándar/desconocidos. Para sus propios datos, péguelos y haga clic en Calcular (o Restablecer). Saltar a resultados

Consejos de ponderación WLS

WLS se ajusta con pesos puntuales. 1/Q y 1/Q² aumentar la influencia de los puntos de baja cantidad. Utilice el w columna para establecer pesos por punto.

Resultados (resumen)

PCR eficiencia (%)

Calculado a partir de la pendiente m como Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100. El rango mostrado es una guía.

Los resultados aparecerán aquí.

Los rangos son guías. Para investigación/educación, revisen juntos los puntos estándar y los residuales.

Controles de calidad (guía)

Niveles de concentración (media ± DE)

Cantidad registro10Q norte Ct_media Ct_SD

Puntos estándar (filas ajustadas)

Las columnas avanzadas (peso / yhat / residual / apalancamiento / cooksD) se pueden alternar.

Cantidad registro10Q CT peso y eso residual apalancamiento cocinerosD

Muestras desconocidas (Ct → Cantidad)

muestra CT log10Q_sombrero Cantidad_sombrero DF Cantidad_corregida

Curva estándar y residuos

Curva estándar (Ct vs log10(Cantidad))
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Pase el cursor sobre los puntos para ver los detalles.
Ct residual versus previsto
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Pase el cursor sobre los puntos para ver los detalles.

Pasos de cálculo (Cómo se calcula)

    Notas para educadores

    Preguntas frecuentes

    ¿Qué es una curva estándar qPCR?

    Una curva que relaciona la cantidad estándar (número de copias o concentración) con Ct ajustando Ct frente a log10 (cantidad). Ayuda a comprobar la linealidad (R²) y la eficiencia de amplificación.

    ¿Cuántos puntos estándar se requieren?

    Se requieren al menos dos puntos para ajustar una línea. Para comprobaciones de linealidad y valores atípicos, se recomiendan entre 4 y 6 puntos.

    ¿Cómo se calcula la eficiencia (%) de PCR?

    Desde la pendiente m: Eficiencia = (10^(-1/m) - 1) × 100. El rango mostrado es una guía.

    ¿Qué indica una pendiente de alrededor de -3,32?

    Para una serie de diluciones de 10×, una pendiente cercana a -3,32 corresponde a una eficiencia aparente de aproximadamente el 100% (guía ideal).

    ¿Puede la eficiencia superar el 100%?

    Debido a que se infiere de la pendiente, pueden ocurrir valores aparentes superiores al 100% debido a un error de dilución o inhibición. Trátelo como una guía y verifique los residuos y los puntos estándar.

    ¿El recurso compartido URL incluye datos?

    Sólo se guardan las configuraciones (métodos y opciones de banda). No se incluyen datos estándar y desconocidos.

    ¿Qué unidad debo usar para la cantidad?

    Cualquier unidad está bien (número de copias, ng, concentración). La cantidad debe ser positiva para log10.

    Referencias (notas)

    Las guías que se muestran en esta página son referencias generales. Para investigación/educación, consulte fuentes primarias según sea necesario.

    Comentarios

    Comparta preguntas o mejoras (los comentarios se cargan después de hacer clic en el botón).