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遺傳學 χ2檢驗

哈代-溫伯格平衡計算:預期頻率與卡方

根據觀察到的 AA/Aa/aa,共同計算等位基因頻率 (p,q)、預期頻率 (p²,2pq,q²)、χ2 和 p 值。您可以在圖表和表格中檢查觀察結果與期望之間的差異。

本頁僅供教育與研究輔助用途,不能取代正式實驗設計、統計審查、臨床判讀或安全規範。

所有計算均在瀏覽器內完成,不發送任何資料。

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範例(預設)

選擇範例後,將填寫輸入內容並立即顯示結果。

描述

輸入

輸入方式

觀測值(AA/Aa/aa)

自由度 (df)
高級(顯示/圖形)

貼上/CSV(可選)

它還支援貼上 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。貼上後,它將反映在輸入字段中。

結果

N(總數)
p(A)
q(a)
MAF(參考)
χ²
df
p 值
判斷(展示用)
霍布斯(觀察異種)
Hexp(預期雜合度)
F(參考)

*這是一個統計計算工具,不用於醫學判斷。

觀察與期望
殘差

*殘差僅在觀測值模式下顯示(高級→“顯示殘差”)。

表(O/E/貢獻)

基因型 觀察到(O) 預期(E) OE (O−E)²/E 殘差

如何使用/計算

  1. 輸入 AA/Aa/aa(也可以使用範例)。
  2. 選擇自由度(預設為 df=1)和顯著性水平(用於顯示)。
  3. 顯示 p、q、預期頻率、χ2、p 值。

等位基因頻率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p

預期頻率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N

χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)

如果預期頻率很小,χ2 檢驗可能會給出較差的近似值。使用前請檢查警告顯示。

根據你已有的資料選擇輸入模式

把 `df=1` 視為常規預設值,因為大多數場景下 p 來自同一樣本的估計。只有在 p 獨立於樣本預先設定時,才考慮 `df=2`。

常見問題

什麼是哈迪-溫伯格平衡 (HWE)?

對兩個等位基因(A 和 a)來說,哈迪-溫伯格平衡把等位基因頻率 p、q 與期望基因型頻率 p²(AA)、2pq(Aa)、q²(aa)聯繫起來,前提是模型假設大致成立。

如何計算 p 和 q?

根據觀察到的 AA/Aa/aa,計算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。

為什麼 χ² 檢驗的自由度(df)通常取 1?

因為常見流程裡 p 是由同一樣本中的觀測值估計出來的,所以 AA/Aa/aa 三分類通常應使用 df=1。只有在 p 獨立於樣本、提前固定時,才考慮 df=2。

如果期望計數很小並出現警告,該怎麼辦?

當期望計數過小,χ² 只是比較粗略的近似。先檢查樣本量和類別是否過於不平衡,再根據需要考慮更精確的檢驗方法。

p 值很小,並不等於一定“不平衡”,對嗎?

對。p 值只是衡量偏離模型的程度,不能脫離樣本量、群體結構、模型假設和資料品質單獨解釋。

它和孟德爾分離比 χ² 檢驗有什麼區別?

兩者都比較觀察值和期望值,但 HWE 的期望值來自同一樣本估計出的 p 和 q;孟德爾分離比檢驗則來自預先設定的遺傳模型。要根據研究設計選擇工具。

該工具的計算結果是否發送到外部?

不會。計算都在瀏覽器本地完成。