範例(預設)
選擇範例後,將填寫輸入內容並立即顯示結果。
輸入
觀測值(AA/Aa/aa)
僅當選擇 df=2(p 固定)時使用。
給定 p(僅計算期望頻數)
此模式不計算 χ2 檢驗(p 值)。
等位基因數 (A, a)
此模式不計算 χ2 檢驗(p 值)。
高級(顯示/圖形)
貼上/CSV(可選)
它還支援貼上 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。貼上後,它將反映在輸入字段中。
結果
—
*這是一個統計計算工具,不用於醫學判斷。
圖
*殘差僅在觀測值模式下顯示(高級→“顯示殘差”)。
表(O/E/貢獻)
| 基因型 | 觀察到(O) | 預期(E) | OE | (O−E)²/E | 殘差 |
|---|
如何使用/計算
- 輸入 AA/Aa/aa(也可以使用範例)。
- 選擇自由度(預設為 df=1)和顯著性水平(用於顯示)。
- 顯示 p、q、預期頻率、χ2、p 值。
等位基因頻率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
預期頻率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)
如果預期頻率很小,χ2 檢驗可能會給出較差的近似值。使用前請檢查警告顯示。
根據你已有的資料選擇輸入模式
- 有 觀測基因型計數(AA/Aa/aa) 時,用這個模式查看 χ² 和 p 值。
- 只想根據假定等位基因頻率和樣本量得到期望頻率時,用 指定 p。
- 資料源只有等位基因總數而不是完整基因型計數時,用 等位基因數量。
把 `df=1` 視為常規預設值,因為大多數場景下 p 來自同一樣本的估計。只有在 p 獨立於樣本預先設定時,才考慮 `df=2`。
常見問題
什麼是哈迪-溫伯格平衡 (HWE)?
對兩個等位基因(A 和 a)來說,哈迪-溫伯格平衡把等位基因頻率 p、q 與期望基因型頻率 p²(AA)、2pq(Aa)、q²(aa)聯繫起來,前提是模型假設大致成立。
如何計算 p 和 q?
根據觀察到的 AA/Aa/aa,計算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。
為什麼 χ² 檢驗的自由度(df)通常取 1?
因為常見流程裡 p 是由同一樣本中的觀測值估計出來的,所以 AA/Aa/aa 三分類通常應使用 df=1。只有在 p 獨立於樣本、提前固定時,才考慮 df=2。
如果期望計數很小並出現警告,該怎麼辦?
當期望計數過小,χ² 只是比較粗略的近似。先檢查樣本量和類別是否過於不平衡,再根據需要考慮更精確的檢驗方法。
p 值很小,並不等於一定“不平衡”,對嗎?
對。p 值只是衡量偏離模型的程度,不能脫離樣本量、群體結構、模型假設和資料品質單獨解釋。
它和孟德爾分離比 χ² 檢驗有什麼區別?
兩者都比較觀察值和期望值,但 HWE 的期望值來自同一樣本估計出的 p 和 q;孟德爾分離比檢驗則來自預先設定的遺傳模型。要根據研究設計選擇工具。
該工具的計算結果是否發送到外部?
不會。計算都在瀏覽器本地完成。
相關工具
- 孟德爾分離比 χ2 檢驗計算機當期望計數來自遺傳分離模型,而不是樣本內估計的 p 和 q 時,用這個工具更合適。
- Punnett Square一代(1基因/2基因)適合先快速查看雜交結果的期望比例,再決定是否繼續做平衡檢驗。
- 遺傳漂浮模擬器(Wright–Fisher)當問題轉向遺傳漂變和多代等位基因頻率變化時,改用這個模擬器。