Exemple (préréglé)
Une fois que vous avez sélectionné un exemple, l'entrée sera renseignée et les résultats apparaîtront immédiatement.
entrée
Valeur observée (AA/Aa/aa)
Utilisé uniquement lorsque df=2 (p fixe) est sélectionné.
spécification p (uniquement la fréquence attendue)
Ce mode ne calcule pas le test χ² (valeur p).
Nombre d'allèles (A, a)
Ce mode ne calcule pas le test χ² (valeur p).
Avancé (affichage/graphique)
Coller / CSV (facultatif)
Il prend également en charge le collage de TSV/CSV (par ex.AA Aa aa). Une fois collé, il sera reflété dans le champ de saisie.
résultat
—
*Il s'agit d'un outil de calcul statistique et n'est pas destiné à un jugement médical.
graphique
*Les résidus sont affichés uniquement en mode valeur observée (Avancé → "Afficher les résidus").
Tableau (O/E/Contribution)
| génotype | observé(O) | attendu (E) | O-E | (O−E)²/E | résiduel |
|---|
Comment utiliser/calculer
- Saisissez AA/Aa/aa (vous pouvez également utiliser l'exemple).
- Sélectionnez les degrés de liberté (la valeur par défaut est df=1) et le niveau de signification (pour l'affichage).
- p,q, fréquence attendue, χ², valeur p sont affichés.
fréquence allélique:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
Fréquence attendue (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²: Σ (O−E)²/E (somme de AA, Aa, aa)
Si les fréquences attendues sont petites, le test χ² peut donner une mauvaise approximation. Veuillez vérifier l'affichage d'avertissement avant utilisation.
Choisissez le mode d'entrée selon les données que vous avez déjà
- Utilisez Valeurs observées (AA/Aa/aa) lorsque vous avez des effectifs de génotypes et que vous voulez χ² plus la valeur p.
- Utilisez Spécifier p lorsque vous voulez seulement les fréquences attendues à partir d'une fréquence allélique supposée et d'une taille d'échantillon.
- Utilisez Nombre d'allèles lorsque la source fournit des totaux alléliques plutôt que des génotypes complets.
Le choix `df=1` convient au cas courant où p est estimé à partir du même échantillon. Réservez `df=2` aux situations avancées où p est fixé indépendamment.
Questions fréquemment posées (FAQ)
Qu'est-ce que l'équilibre de Hardy-Weinberg (HWE) ?
Avec deux allèles (A et a), l'équilibre de Hardy-Weinberg relie les fréquences alléliques p et q aux fréquences génotypiques attendues p² (AA), 2pq (Aa) et q² (aa), tant que les hypothèses du modèle restent plausibles.
Comment calcule-t-on p et q ?
À partir des AA/Aa/aa observés, calculez p = (2*AA + Aa)/(2N), q = 1 - p.
Pourquoi le degré de liberté (df) du test χ² est-il souvent égal à 1 ?
Lorsque p est estimé à partir du même échantillon observé, df=1 est généralement le bon choix pour des effectifs AA/Aa/aa. Utilisez df=2 seulement dans les cas avancés où p est fixé séparément.
Que faire si un avertissement apparaît parce qu'un effectif attendu est faible ?
Si les effectifs attendus sont faibles, χ² devient une approximation plus fragile. Vérifiez la taille d'échantillon, l'équilibre des classes, puis envisagez un test exact si votre protocole l'exige.
Petite valeur p = pas nécessairement d'équilibre, n'est-ce pas ?
La valeur p mesure l'ampleur de l'écart au regard du modèle. Elle ne suffit pas à elle seule: l'interprétation dépend aussi de la taille d'échantillon, de la structure de population, des hypothèses et de la qualité des données.
Quelle est la différence avec le test χ² pour le rapport de séparation mendélien ?
Les deux tests comparent des effectifs observés et attendus, mais HWE construit les attentes à partir de p et q estimés dans le même échantillon. Utilisez le test mendélien lorsque les attentes viennent d'un modèle d'hérédité défini à l'avance.
Les calculs de cet outil sont-ils envoyés en externe ?
Non. Les calculs sont réalisés localement dans le navigateur.
Outils associés
- Calculateur de test du rapport de séparation mendélienne χ²À utiliser quand les effectifs attendus viennent d'un modèle d'hérédité plutôt que de p et q estimés dans l'échantillon.
- Génération Punnett Square (1 gène/2 gènes)Pratique pour visualiser rapidement les croisements attendus avant de passer au test d'équilibre.
- Simulateur génétique flottant (Wright–Fisher)Ouvrez-le lorsque la question porte sur la dérive génétique et l'évolution des fréquences alléliques au fil des générations.