示例(预设)
选择示例后,将填写输入内容并立即显示结果。
输入
观测值(AA/Aa/aa)
仅当选择 df=2(p 固定)时使用。
p 规格(仅预期频率)
此模式不计算 χ2 检验(p 值)。
等位基因数 (A, a)
此模式不计算 χ2 检验(p 值)。
高级(显示/图形)
粘贴/CSV(可选)
它还支持粘贴 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。粘贴后,它将反映在输入字段中。
结果
—
*这是一个统计计算工具,不用于医学判断。
图
*残差仅在观测值模式下显示(高级→“显示残差”)。
表(O/E/贡献)
| 基因型 | 观察到(O) | 预期(E) | OE | (O−E)²/E | 残差 |
|---|
如何使用/计算
- 输入 AA/Aa/aa(也可以使用示例)。
- 选择自由度(默认为 df=1)和显着性水平(用于显示)。
- 显示 p、q、预期频率、χ2、p 值。
等位基因频率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
预期频率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)
如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出较差的近似值。使用前请检查警告显示。
根据你已有的数据选择输入模式
- 有 观测基因型计数(AA/Aa/aa) 时,用这个模式查看 χ² 和 p 值。
- 只想根据假定等位基因频率和样本量得到期望频率时,用 指定 p。
- 数据源只有等位基因总数而不是完整基因型计数时,用 等位基因数量。
把 `df=1` 视为常规默认值,因为大多数场景下 p 来自同一样本的估计。只有在 p 独立于样本预先设定时,才考虑 `df=2`。
常见问题
什么是哈迪-温伯格平衡 (HWE)?
对两个等位基因(A 和 a)来说,哈迪-温伯格平衡把等位基因频率 p、q 与期望基因型频率 p²(AA)、2pq(Aa)、q²(aa)联系起来,前提是模型假设大致成立。
如何计算 p 和 q?
根据观察到的 AA/Aa/aa,计算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。
为什么 χ² 检验的自由度(df)通常取 1?
因为常见流程里 p 是由同一样本中的观测值估计出来的,所以 AA/Aa/aa 三分类通常应使用 df=1。只有在 p 独立于样本、提前固定时,才考虑 df=2。
如果期望计数很小并出现警告,该怎么办?
当期望计数过小,χ² 只是比较粗略的近似。先检查样本量和类别是否过于不平衡,再根据需要考虑更精确的检验方法。
p 值很小,并不等于一定“不平衡”,对吗?
对。p 值只是衡量偏离模型的程度,不能脱离样本量、群体结构、模型假设和数据质量单独解释。
它和孟德尔分离比 χ² 检验有什么区别?
两者都比较观察值和期望值,但 HWE 的期望值来自同一样本估计出的 p 和 q;孟德尔分离比检验则来自预先设定的遗传模型。要根据研究设计选择工具。
该工具的计算结果是否发送到外部?
不会。计算都在浏览器本地完成。
相关工具
- 孟德尔分离比 χ2 检验计算器当期望计数来自遗传分离模型,而不是样本内估计的 p 和 q 时,用这个工具更合适。
- Punnett Square一代(1基因/2基因)适合先快速查看杂交结果的期望比例,再决定是否继续做平衡检验。
- 遗传漂浮模拟器(Wright–Fisher)当问题转向遗传漂变和多代等位基因频率变化时,改用这个模拟器。