← 生物学

遗传学 χ2检验

Hardy-Weinberg 平衡(定律)计算:预期频率/χ2

根据观察到的 AA/Aa/aa,共同计算等位基因频率 (p,q)、预期频率 (p²,2pq,q²)、χ2 和 p 值。您可以在图表和表格中检查观察结果与期望之间的差异。

所有计算均在浏览器内完成,不发送任何数据。

其他语言 日本語 | English | 简体中文 | Español | Português (Brasil) | Bahasa Indonesia | Français | हिन्दी | العربية

示例(预设)

选择示例后,将填写输入内容并立即显示结果。

描述

输入

输入方式

观测值(AA/Aa/aa)

自由度 (df)
高级(显示/图形)

粘贴/CSV(可选)

它还支持粘贴 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。粘贴后,它将反映在输入字段中。

结果

N(总数)
p(A)
q(一)
MAF(参考)
χ²
df
p 值
判断(展示用)
霍布斯(观察异种)
Hep(预期异质)
F(参考)

*这是一个统计计算工具,不用于医学判断。

观察与期望
残差

*残差仅在观测值模式下显示(高级→“显示残差”)。

表(O/E/贡献)

基因型 观察到(O) 预期(E) OE (O−E)²/E 残差

如何使用/计算

  1. 输入 AA/Aa/aa(也可以使用示例)。
  2. 选择自由度(默认为 df=1)和显着性水平(用于显示)。
  3. 显示 p、q、预期频率、χ2、p 值。

等位基因频率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p

预期频率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N

χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)

如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出较差的近似值。使用前请检查警告显示。

根据你已有的数据选择输入模式

把 `df=1` 视为常规默认值,因为大多数场景下 p 来自同一样本的估计。只有在 p 独立于样本预先设定时,才考虑 `df=2`。

常见问题

什么是哈迪-温伯格平衡 (HWE)?

对两个等位基因(A 和 a)来说,哈迪-温伯格平衡把等位基因频率 p、q 与期望基因型频率 p²(AA)、2pq(Aa)、q²(aa)联系起来,前提是模型假设大致成立。

如何计算 p 和 q?

根据观察到的 AA/Aa/aa,计算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。

为什么 χ² 检验的自由度(df)通常取 1?

因为常见流程里 p 是由同一样本中的观测值估计出来的,所以 AA/Aa/aa 三分类通常应使用 df=1。只有在 p 独立于样本、提前固定时,才考虑 df=2。

如果期望计数很小并出现警告,该怎么办?

当期望计数过小,χ² 只是比较粗略的近似。先检查样本量和类别是否过于不平衡,再根据需要考虑更精确的检验方法。

p 值很小,并不等于一定“不平衡”,对吗?

对。p 值只是衡量偏离模型的程度,不能脱离样本量、群体结构、模型假设和数据质量单独解释。

它和孟德尔分离比 χ² 检验有什么区别?

两者都比较观察值和期望值,但 HWE 的期望值来自同一样本估计出的 p 和 q;孟德尔分离比检验则来自预先设定的遗传模型。要根据研究设计选择工具。

该工具的计算结果是否发送到外部?

不会。计算都在浏览器本地完成。