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分子生物學 克隆

DNA 組裝混合液計算器

根據 Gibson 或 Golden Gate 的主鏈/插入片段莫耳比計算所需的 DNA 質量和體積。如果提供了濃度,則計算總反應的體積和剩餘水。

所有計算都在您的瀏覽器中執行。沒有發送任何資料。

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使用方法(3步)

  1. 選擇一個範例或輸入主鏈和插入片段的片段長度 (bp) 和濃度 (ng/μL)。
  2. 選擇莫耳比(例如,插入 2×)和主鏈量(pmol 或 ng)。
  3. 將顯示所需的質量 (ng) 和體積 (μL),以及配方(主混合物/試劑和剩餘的水)。

這是一個數量計算器。推薦的條件因試劑組和方案而異,因此請遵循您的方案。 Golden Gate 試劑預設僅作為計算範例。

輸入(片段表)

莫耳比反映分子計數。不同的長度意味著相同質量下的不同分子數。
詳細信息(每個鹼基對的分子量)
使用 660 g/mol/bp 作為 dsDNA 的近似值。
名稱 角色 長度(bp) 濃度(納克/微升) 行動
粘貼 TSV(可選)

從 Excel/表格粘貼(製表符分隔)。

結果

剩餘水量 (µL)
總 DNA 體積 (µL)
總 DNA 質量 (ng)
2× 主混音 體積(微升)
片段 角色 長度(bp) 目標(pmol) 質量(納克) 體積(微升) 注意事項

該工具僅計算金額。它並不能保證成功。

計算方法

  1. 作為 dsDNA 近似值, pmol =(質量ng×1000)/(bp×660).
  2. 設置骨架片段量(pmol 為 Gibson,ng 為 Golden Gate)並計算骨架片段 pmol。
  3. 每個插入目標是 insert_target_pmol =backbone_pmol × 比率,然後轉換為質量 (ng)。
  4. 如果濃度 (ng/µL) 已知, 體積=質量/濃度 給出體積 (μL)。
  5. 剩餘水的計算方法是總反應體積減去主混合物/試劑和 DNA 體積。

價值觀是指導。按照您的試劑組/方案瞭解最終條件。

常見問題

Gibson 和 Golden Gate 有什麼區別?
兩者都組裝 DNA 片段,但反應機制和酶不同。該工具計算要混合多少 DNA。
為什麼使用莫耳比?
不同長度的片段在相同質量下具有不同的分子數。莫耳比使分子計數保持一致。
常用的比例有哪些?
根據經驗,插入片段通常是骨架片段的 2 倍或 3 倍。這取決於組裝,應該進行測試。
我可以在沒有濃度值的情況下使用它嗎?
是的。您仍然可以計算所需的質量 (ng)。僅當提供濃度時才會顯示體積 (μL)。
我的體積非常小(例如 0.1 µL)。
非常小的體積很容易出錯。考慮中間稀釋或調整骨架量和反應體積。
我可以按原樣使用 Golden Gate 試劑預設嗎?
試劑量取決於試劑組和方案。預設僅作為計算範例;遵循您的實驗流程。
這些金額能保證成功嗎?
不可以。該工具僅計算金額。成功取決於設計、DNA 質量和反應條件。