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जैवरसायन वक्र फिटिंग

IC50/EC50 कैलकुलेटर (खुराक-प्रतिक्रिया वक्र फ़िट: 4PL/5PL)

एकाग्रता-प्रतिक्रिया डेटा से IC50/EC50 (50% बिंदु) का अनुमान लगाएँ। 4PL और 5PL की तुलना करें, निषेध या सक्रियण चुनें, और फिट मेट्रिक्स देखें। माध्य±SD, अवशिष्ट और outlier नियंत्रण भी उपलब्ध हैं।

सभी गणनाएँ आपके ब्राउज़र में चलती हैं; डेटा बाहर नहीं भेजा जाता।

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उदाहरण (पूर्व निर्धारित)

इनपुट भरने और तुरंत परिणाम देखने के लिए एक उदाहरण चुनें।

विवरण
—
कैसे उपयोग करें (3 चरण)
  1. एकाग्रता और प्रतिक्रिया चिपकाएँ (समर्थित कॉलम दोहराएँ) या एक CSV/TSV फ़ाइल आयात करें।
  2. दिशा (निषेध/सक्रियण) और मॉडल (ऑटो/4पीएल/5पीएल) का चयन करें।
  3. IC50/EC50 (50% बिंदु), फिट कर्व और फिट मेट्रिक्स दिखाए गए हैं।

यह एक विश्लेषण उपकरण है। 4PL/5PL की परिभाषाएँ अलग सॉफ़्टवेयर में भिन्न हो सकती हैं। इसलिए समीकरण और “50% बिंदु” की परिभाषा जाँचें। 5PL में विभक्ति पैरामीटर 50% बिंदु से अलग हो सकता है।

इनपुट (पेस्ट / CSV)

प्रारूप: कॉलम 1 = एकाग्रता, कॉलम 2+ = प्रतिक्रिया (रेप1, रेप2,…)। TSV/CSV समर्थित है।

बिंदु बहिष्करण (वैकल्पिक)
बहिष्कृत
—
क्रियाएँ

सेटिंग्स (न्यूनतम आवश्यक)

उन्नत (वैकल्पिक)
नोट
5PL में, विभक्ति पैरामीटर 50% बिंदु से भिन्न हो सकता है। परिणाम कार्ड में विवरण देखें.

परिणाम

—
—
pIC50 (M)
—
मॉडल—
दिशा—
अंक (संक्षेप > 0)—
R²—
आरएमएसई—
एआईसी / AICc / बीआईसी— / — / —
मॉडल तुलना (ऑटो)—

ग्राफ़

बिंदुओं को बाहर करने के लिए, इनपुट अनुभाग में “बिंदु बहिष्करण” चालू करें।

तालिका (औसत ± SD, पूर्वानुमानित, अवशिष्ट)

एकाग्रता औसत एस.डी पूर्वानुमान अवशिष्ट बहिष्कृत

पैरामीटर्स

पैरामीटर अनुमान 95% सीआई (सक्षम होने पर)

95% सीआई एक सन्निकटन (रैखिकीकरण) है। जब आपके पास कुछ बिंदु या आउटलेयर हों, तो उस पर अधिक भरोसा न करें। 5PL में 50% बिंदु विभक्ति-पैरामीटर EC50 से भिन्न हो सकता है। इसलिए परिणाम कार्ड के नोट्स के साथ परिणाम पढ़ें।

4पीएल/5पीएल और 50% अंक

यह उपकरण 4PL (सममित) या 5PL (असममित) के साथ खुराक-प्रतिक्रिया वक्र को फिट करता है। फिर ऊपर और नीचे (50% बिंदु) के बीच के मध्यबिंदु की गणना IC50/EC50 के रूप में करता है।

फिटिंग लेवेनबर्ग-मार्क्वार्ड (नॉनलाइनियर न्यूनतम वर्ग) का उपयोग करती है। एसडी वेटिंग सक्षम होने पर, प्रत्येक बिंदु को 1/एसडी द्वारा भारित किया जाता है2.

समीकरण (संदर्भ)

यहाँ, एकाग्रता x सकारात्मक है.

  • 4PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50)^hill)
  • 5PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50_param)^hill)^asym

5PL में, EC50_param हमेशा "50% बिंदु" नहीं होता है। यह टूल 50% बिंदु की अलग से गणना करता है और इसे स्पष्ट रूप से दिखाता है।

शून्य सांद्रता (नियंत्रण) सामान्यीकरण में मदद कर सकता है। लेकिन इसका उपयोग लॉग एक्स-अक्ष पर नहीं किया जा सकता। इसलिए इसे फिटिंग से बाहर करना आमतौर पर सुरक्षित होता है।

सामान्य प्रश्न

IC50 और EC50 के बीच क्या अंतर है?
अक्सर, IC50 का उपयोग अवरोध के लिए किया जाता है (उच्च सांद्रता के साथ प्रतिक्रिया कम हो जाती है) और EC50 का उपयोग सक्रियण के लिए किया जाता है (प्रतिक्रिया बढ़ जाती है)। यह उपकरण 50% बिंदु की गणना करता है और इसे चयनित दिशा के आधार पर लेबल करता है।
4PL और 5PL में क्या अंतर है?
4PL एक सममित सिग्मोइडल वक्र मानता है। 5PL असममित सिग्मॉइड मॉडल कर सकता है और बाएं और दाएं पक्ष भिन्न होने पर बेहतर फिट हो सकता है।
क्या 5PL EC50 पैरामीटर 50% बिंदु के समान है?
हमेशा नहीं. 5PL में, विभक्ति पैरामीटर ऊपर और नीचे के मध्य बिंदु से भिन्न हो सकता है। यह उपकरण 50% बिंदु की गणना करता है और स्पष्ट रूप से दिखाता है।
क्या मैं शून्य सांद्रता (नियंत्रण) शामिल कर सकता हूँ?
आप इसे सामान्यीकरण के लिए उपयोग कर सकते हैं, लेकिन 0 का उपयोग लॉग एक्स-अक्ष पर नहीं किया जा सकता है। इसे फिटिंग से बाहर रखना आमतौर पर सुरक्षित होता है (यह उपकरण उस दृष्टिकोण का अनुसरण करता है)।
प्रतिकृतियों को कैसे संभाला जाता है?
फिट प्रत्येक सांद्रता पर माध्य का उपयोग करता है। SD का उपयोग त्रुटि पट्टियों के लिए किया जाता है, और आप वैकल्पिक रूप से 1/SD² तक अंक भारित कर सकते हैं।
pIC50 की गणना कैसे की जाती है?
यदि आपकी x इकाई को मोलर (M) में बदला जा सकता है, तो pIC50 = -log10(IC50[M])। द्रव्यमान सांद्रता इकाइयों (उदाहरण के लिए, एनजी/एमएल) के लिए, यदि आणविक भार ज्ञात हो तो आप परिवर्तित कर सकते हैं।