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qPCR Normalización

Calculadora ΔCt / ΔΔCt (expresión relativa)

Pegue los valores qPCR Ct para calcular ΔCt/ΔΔCt y la expresión relativa (2^-ΔΔCt). Admite la selección de calibradores, múltiples genes de referencia, Pfaffl corrección de eficiencia, gráficos, registros de pasos, CSV/LaTeX y URL compartidas.

Todos los cálculos se ejecutan en su navegador; Los datos no se envían. Sólo para uso en investigación/educación. No para diagnóstico.

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Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Pegue datos (Grupo, Muestra, Ct objetivo, Ct referencia) o cargue un CSV. Para referencias múltiples, utilice Ct ref1, Ct ref2, ...
  2. Seleccione un grupo de calibradores (o muestra) y un método de resumen (media/mediana). Habilite la corrección Pfaffl si es necesario.
  3. Haga clic en Calcular para mostrar ΔCt/ΔΔCt, log2FC y plegar tablas y gráficos. Las URL compartidas mantienen la misma configuración.

Orden recomendado

  1. Primero, verifique la eficiencia con una curva estándar. → qPCR curva estándar
  2. A continuación, calcule ΔCt / ΔΔCt (esta página)
  3. Si es necesario, evalúe la variabilidad o la importancia. → Intervalos de confianza y pruebas de hipótesis.

ir más profundo

Entrada de datos y opciones

Los valores predeterminados son ejemplos. Al seleccionar un ajuste preestablecido se actualizan las entradas y configuraciones inmediatamente. Para sus propios datos, pegue y haga clic en Calcular.

Resultados (resumen)

Los resultados aparecerán aquí.

Resultados por fila

Fila grupo muestra Ct_objetivo ct_ref ΔCt ΔΔCt log2FC doblar valor atípico

Los valores atípicos no se eliminan automáticamente; se muestran como candidatos (basados ​​en IQR).

Resumen del grupo

grupo norte media log2FC registro2FC SD log2FC SEM doblar la media geométrica multiplicar la media aritmética

Gráficos (log2FC/fold)

Pasos de cálculo (Cómo se calcula)

    Preguntas frecuentes

    ¿Cuál es la diferencia entre ΔCt y ΔΔCt?

    ΔCt es la diferencia dentro de la muestra entre el objetivo y la referencia. ΔΔCt es la diferencia relativa a un calibrador.

    ¿Cuál es el supuesto para 2^-ΔΔCt?

    Generalmente se supone que las eficiencias de amplificación objetivo y de referencia son iguales o similares. Utilice la corrección Pfaffl si difieren.

    ¿Debo usar fold o log2FC?

    log2FC es simétrico y más fácil para estadísticas y gráficos. Fold es más intuitivo.

    ¿Cómo se manejan múltiples genes de referencia?

    Cuando se proporcionan Ct ref1, Ct ref2, etc., los valores de Ct de referencia se agregan antes de calcular ΔCt.

    ¿Cuándo debo utilizar la corrección de eficiencia Pfaffl?

    Considere la corrección Pfaffl cuando las eficiencias objetivo y de referencia difieran sustancialmente.

    ¿El recurso compartido URL incluye datos?

    Sólo se guardan las configuraciones; los datos no están incluidos.

    Referencias (notas)

    Los supuestos y guías de esta página son referencias generales. Para investigación/educación, consulte fuentes primarias según sea necesario.

    Comentarios

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