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Biologie moléculaire Clonage

Calculateur de rapport molaire de ligature (vecteur: insertion)

Calculez la masse d’insertion requise (ng) à partir de la masse et de la longueur du vecteur ainsi que d’un rapport molaire cible (par exemple 1:3). Si la concentration est connue, le volume requis (µL) est également affiché.

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Comment utiliser (3 étapes)

  1. Sélectionnez un exemple ou entrez la longueur du vecteur (bp) et insérez la longueur (bp).
  2. Entrez le rapport molaire cible (par exemple, 1:3) et la masse vectorielle (ng).
  3. La masse (ng) et le volume (µL) requis de l'insert sont indiqués (si la concentration est fournie).

Ceci est un calculateur de quantité. Les ratios optimaux dépendent du type de fin et des conditions ; suivez votre protocole.

Entrées (vecteur/insertion)

Choisissez comment définir la quantité de vecteur.
Avancé

Résultats

Insérer la masse (ng)
Insérer le volume (µL)
Volume vectoriel (µL)
Masse totale de DNA (ng)
Volume total de DNA (µL)
DNA Longueur (pb) Masse (ng) Concentration (ng/μL) Volume (µL) pmol (guide)
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Cet outil calcule uniquement les montants. Cela ne garantit pas le succès.

Comment c'est calculé

  1. En tant qu'approximation de l'ADNdb, pmol = (masse_ng × 1000) / (pb × 660).
  2. Calculez le pmol vectoriel à partir de la masse et de la longueur du vecteur.
  3. Insérez pmol cible = vecteur pmol × rapport cible, puis reconvertissez-le en masse (ng).
  4. Si la concentration est connue, volume = masse / concentration.

Les valeurs sont des guides. Suivez votre protocole pour les conditions finales.

FAQ

Pourquoi utiliser des rapports molaires ?
Des fragments de différentes longueurs ont un nombre de molécules différent pour une même masse. Les rapports molaires maintiennent le nombre de molécules cohérent.
Quels ratios sont couramment utilisés ?
Les ratios vecteur:insertion comme 1:3 ou 1:5 sont des points de départ courants. Les ratios optimaux dépendent des fins et des conditions.
Quelle longueur de vecteur dois-je utiliser ?
Utilisez la longueur réelle du fragment de vecteur linéarisé utilisé pour la ligature, souvent la longueur totale du plasmide.
Je ne connais pas la concentration de l'insert.
Vous pouvez toujours calculer la masse requise (ng). Le volume (µL) est affiché uniquement lorsque la concentration est fournie.
Mes volumes sont extrêmement petits (par exemple, 0,1 µL).
Les très petits volumes sont sujets aux erreurs. Envisagez une dilution intermédiaire ou ajustez la masse du vecteur et le volume de réaction.
Ces montants garantiront-ils le succès ?
Non. Cet outil calcule uniquement les montants. Le succès dépend du type de fin, des conditions de réaction et de la qualité DNA.