Indice de diversité Shannon et Simpson

Comment utiliser (3 étapes)

Sélectionnez un exemple ou entrez un tableau de décompte (étiquettes et décomptes).
Ajustez la base du logarithme de Shannon ou les options d'affichage si nécessaire.
Les indices de Shannon et de Simpson ainsi que, facultativement, les nombres de Hill et l'équitabilité sont affichés.

Les indices de diversité dépendent de l'échantillonnage et du prétraitement (filtrage, normalisation, etc.). Interpréter les résultats avec les conditions.

Entrée (tableau de comptage)

Exemple (préréglé)

—

Mode de saisie

étiquette	compter	Actions

Coller (TSV/CSV)

Deux colonnes : étiquette, nombre (en-tête facultatif).

Coller (TSV/CSV)

La première colonne est l'étiquette, les colonnes restantes sont des échantillons (en-tête recommandé).

Options d'affichage

Base du logarithme de Shannon Affichage principal Simpson Ordre des catégories Chiffres significatifs

Afficher les nombres Hill (q=0/1/2) Montrer l'uniformité (Pielou J) Afficher p en % Afficher p sous forme de décimales

Mise à jour automatique

Résultats (Shannon et Simpson)

—

N (total)

—

S (espèces/catégories)

—

Shannon H

—

Dans : —

Simpson

—

D : — / 1−D : — / 1/D : —

Hill nombres (q=0/1/2)

—

Uniformité (Pielou J)

—

Abondance relative (p)

Contribution Shannon (−p ln p)

Principales catégories

étiquette	effectif	p

Sorties

Comment c'est calculé

Calculez les proportions p, puis les indices de Shannon (−Σp ln p) et de Simpson (Σp², etc.).
Comme plusieurs conventions existent pour l'indice de Simpson, D, 1−D et 1/D sont affichés ensemble.
Les nombres de Hill (q=0/1/2) et l'équitabilité peuvent également être affichés.

FAQ

Quelle est la différence entre ln et log2 pour Shannon ?

Seule la base du logarithme change ; le classement des échantillons reste identique. Choisissez la base selon les conventions de votre domaine (ln par défaut).

Qu'appelle-t-on « l'indice de Simpson » ?

La littérature varie entre D (Σp²), 1−D et 1/D. Cet outil montre les trois.

Est-il acceptable d'inclure des comptes nuls ?

Oui. Ils sont traités comme p=0 avec une contribution nulle.

Puis-je comparer des échantillons ?

Oui. Le mode multi-échantillons (par colonnes) calcule les indices pour chaque colonne.

Mes entrées sont-elles envoyées n’importe où ?

Tous les calculs s'exécutent dans votre navigateur. Vos données ne sont pas envoyées.

Outils associés

Commentaires (facultatif)

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