Slik bruker du (3 trinn)
- Velg nukleinsyretype (dsDNA, etc.) og lengde (bp/nt).
- Skriv inn én kjent verdi blant ng/µL, nM eller kopier/µL.
- Andre verdier beregnes automatisk. Angi volum for å se totaler.
Inndata (type, lengde, konsentrasjon)
Resultater (ng/µL, nM, kopier)
Resultater vil vises her.
—————————
Hvordan det beregnes
- Molekylvekt = lengde × faktor (ca.)
mol/L = g/L ÷ molekylvektkopier/L = mol/L × Avogadros konstant- Inntasting av volum gir totalt ng, totalt pmol og totalt antall kopier.
Vanlige spørsmål
Hva er 10 ng/µL i nM?
Det avhenger av fragmentlengde og nukleinsyretype. De samme 10 ng/µL gir en mye høyere nM-verdi for et kort fragment enn for et langt amplikon eller transkript.
Hvordan beregnes kopitall?
Verktøyet konverterer massekonsentrasjon til molar konsentrasjon gjennom molekylvekt, og multipliserer deretter den molare mengden med Avogadros konstant for å få kopier.
Hvorfor er faktorer forskjellig mellom dsDNA og RNA?
Gjennomsnittlig molekylvekt per base eller basepar varierer etter nukleinsyretype. Dette verktøyet bruker standard omtrentlige faktorer for dsDNA, ssDNA, RNA og oligoer.
Kan jeg konvertere uten lengde (bp/nt)?
Lengde er nødvendig for å beregne molekylvekt. Hvis du vet den nøyaktige molekylvekten, skriv den inn direkte som g/mol.
Hva viser inntasting av volum?
Den beregner total masse, total pmol og totale kopier i det angitte volumet, noe som er nyttig for rørtotaler, alikvoter og fortynningsplanlegging.
Hva inkluderer delings-URLen?
Den gjenoppretter inngangsverdier (type, lengde, enheter, etc.).
Slik velger du riktig resultat først
For qPCR og standarder
Hvis du utarbeider standarder eller malestimater, er kopier/µL ofte målresultatet. Start fra ng/µL eller nM, konverter deretter til kopier/µL etter å ha bekreftet fragmentlengden og om molekylet er dsDNA, ssDNA eller RNA.
For arbeidsflyter for NGS og fortynning
Hvis du slår sammen biblioteker eller målretter mot lik molar innmating, er nM vanligvis resultatet du trenger først. Konverter fra ng/µL ved å bruke fragmentlengden som samsvarer med den faktiske innsettings- eller bibliotekstørrelsesfordelingen som brukes i arbeidsflyten.
For raske rimelighetskontroller
Hvis et annet verktøy gir et helt annet svar, sammenligner du først fragmentlengden, nukleinsyretypen og molekylvektkonvensjonen. Sjekk disse forutsetningene før du bestemmer deg for at ett resultat er feil.
Relaterte verktøy
- NGS-bibliotekkonsentrasjon (ng/µL → nM) | fortynning | CalcBEKonverter bibliotekets massekonsentrasjon til nM, sjekk deretter fortynnings- og sammenslåingsmål for sekvenseringsforberedelser.
- A260-kalkulator (DNA/RNA-konsentrasjon og renhet) | CalcBEEstimer nukleinsyrekonsentrasjon og renhet fra absorbans før konvertering til molare eller kopibaserte enheter.
- Kalkulator for DNA monteringsblanding (Gibson/Golden Gate) | CalcBEPlanlegg ryggrad og sett inn mengder etter å ha konvertert lagerkonsentrasjonene dine til en sammenlignbar molar basis.
- qPCR standard kurveGjør kopiantall om til standardkurvekontroller og fortynningsserieplanlegging for qPCR-kjøringer.
- Sentrifugeomformer (rpm ↔ RCF ×g) | etter rotorradius | CalcBESjekk sentrifugeinnstillingene ved siden av prøveforberedende trinn når du beveger deg mellom konsentrasjons- og oppryddingsarbeidsflyter.
Tilbakemelding
Fortell oss problemer eller forbedringsideer for å hjelpe med å avgrense dette verktøyet.