Sådan bruges (3 trin)
- Vælg nukleinsyretype (dsDNA osv.) og længde (bp/nt).
- Indtast en kendt værdi blandt ng/µL, nM eller kopier/µL.
- Andre værdier beregnes automatisk. Indtast volumen for at se totaler.
Inddata (type, længde, koncentration)
Resultater (ng/µL, nM, kopier)
Resultaterne vises her.
—————————
hvordan det er beregnet
- Molekylvægt = længde × faktor (ca.)
mol/L = g/L ÷ molekylvægtkopier/L = mol/L × Avogadros konstant- Indtastning af volumen giver total ng, total pmol og samlede kopier.
Ofte stillede spørgsmål
Hvad er 10 ng/µL i nM?
Det afhænger af fragmentlængde og nukleinsyretype. De samme 10 ng/µL giver en meget højere nM-værdi for et kort fragment end for et langt amplikon eller transkript.
Hvordan beregnes kopital?
Værktøjet konverterer massekoncentration til molær koncentration gennem molekylvægt og multiplicerer derefter den molære mængde med Avogadros konstant for at få kopier.
Hvorfor er faktorer forskellige mellem dsDNA og RNA?
Gennemsnitlig molekylvægt pr. base eller basepar varierer efter nukleinsyretype. Dette værktøj bruger omtrentlige standardfaktorer for dsDNA, ssDNA, RNA og oligoer.
Kan jeg konvertere uden længde (bp/nt)?
Længde er nødvendig for at estimere molekylvægt. Hvis du kender den nøjagtige molekylvægt, skal du indtaste den direkte som g/mol.
Hvad viser indtastning af volumen?
Den beregner total masse, total pmol og samlede kopier i det indtastede volumen, hvilket er nyttigt til rørtotaler, aliquoter og fortyndingsplanlægning.
Hvad omfatter delings-URL'en?
Den gendanner indtastede værdier (type, længde, enheder osv.).
Sådan vælger du det rigtige resultat først
Til qPCR og standarder
Hvis du udarbejder standarder eller skabelonestimater, er kopier/µL ofte målresultatet. Start fra ng/µL eller nM, konverter derefter til kopier/µL først efter bekræftelse af fragmentlængde og om molekylet er dsDNA, ssDNA eller RNA.
Til NGS- og fortyndingsarbejdsgange
Hvis du samler biblioteker eller målretter mod ens molær inddata, er nM normalt det resultat, du har brug for først. Konverter fra ng/µL ved hjælp af fragmentlængden, der matcher den faktiske indsættelses- eller biblioteksstørrelsesfordeling, der bruges i arbejdsgangen.
Til hurtige fornuftstjek
Hvis et andet værktøj giver et meget andet svar, skal du først sammenligne fragmentlængden, nukleinsyretypen og molekylvægtkonventionen. Tjek disse antagelser, før du beslutter, at et resultat er forkert.
Relaterede værktøjer
- NGS-bibliotekskoncentration (ng/µL → nM) | fortynding | CalcBEKonverter bibliotekets massekoncentration til nM, og kontroller derefter fortynding og pooling mål for sekventering forberedelse.
- A260 Beregner (DNA/RNA-koncentration og renhed) | CalcBEEstimer nukleinsyrekoncentration og renhed ud fra absorbans før konvertering til molære eller kopibaserede enheder.
- DNA assembly mix regnemaskine (Gibson/Golden Gate) | CalcBEPlanlæg rygrad og indsæt mængder efter konvertering af dine stamkoncentrationer til en sammenlignelig molær basis.
- qPCR standardkurveGør kopiantal antagelser til standardkurvekontrol og fortyndingsserieplanlægning for qPCR-kørsler.
- Centrifugekonverter (rpm ↔ RCF ×g) | ved rotorradius | CalcBEKontroller centrifugeindstillingerne sammen med prøveforberedelsestrinene, når du bevæger dig mellem koncentrations- og oprydningsarbejdsgange.
Feedback
Fortæl os problemer eller forbedringsideer for at hjælpe med at forfine dette værktøj.