Hur man använder (3 steg)
- Välj nukleinsyratyp (dsDNA, etc.) och längd (bp/nt).
- Ange ett känt värde bland ng/µL, nM eller kopior/µL.
- Övriga värden beräknas automatiskt. Ange volym för att se totalsummor.
Indata (typ, längd, koncentration)
Resultat (ng/µL, nM, kopior)
Resultaten visas här.
—————————
Hur det beräknas
- Molekylvikt = längd × faktor (ungefärligt)
mol/L = g/L ÷ molekylviktkopior/L = mol/L × Avogadros konstant- Inmatning av volym ger total ng, total pmol och totala kopior.
Vanliga frågor
Vad är 10 ng/µL i nM?
Det beror på fragmentets längd och nukleinsyratyp. Samma 10 ng/µL ger ett mycket högre nM-värde för ett kort fragment än för ett långt amplikon eller transkript.
Hur beräknas antalet kopior?
Verktyget omvandlar masskoncentration till molär koncentration genom molekylvikt och multiplicerar sedan den molära mängden med Avogadros konstant för att få kopior.
Varför skiljer sig faktorer mellan dsDNA och RNA?
Genomsnittlig molekylvikt per bas eller baspar skiljer sig åt beroende på nukleinsyratyp. Det här verktyget använder ungefärliga standardfaktorer för dsDNA, ssDNA, RNA och oligo.
Kan jag konvertera utan längd (bp/nt)?
Längd behövs för att uppskatta molekylvikten. Om du vet den exakta molekylvikten anger du den direkt som g/mol.
Vad visar inmatningsvolymen?
Den beräknar total massa, total pmol och totala kopior i den angivna volymen, vilket är användbart för rörtotal, alikvoter och utspädningsplanering.
Vad innehåller delade URL:en?
Den återställer ingångsvärden (typ, längd, enheter, etc.).
Så väljer du rätt resultat först
För qPCR och standarder
Om du förbereder standarder eller malluppskattningar är kopior/µL ofta målresultatet. Börja från ng/µL eller nM, konvertera sedan till kopior/µL först efter att ha bekräftat fragmentlängden och om molekylen är dsDNA, ssDNA eller RNA.
För arbetsflöden för NGS och utspädning
Om du slår ihop bibliotek eller riktar in dig på lik molär inmatning, är nM vanligtvis det resultat du behöver först. Konvertera från ng/µL med den fragmentlängd som matchar den faktiska insättnings- eller biblioteksstorleksfördelningen som används i arbetsflödet.
För snabba rimlighetskontroller
Om ett annat verktyg ger ett helt annat svar, jämför först fragmentlängden, nukleinsyratypen och molekylviktskonventionen. Kontrollera dessa antaganden innan du bestämmer att ett resultat är fel.
Relaterade verktyg
- NGS-bibliotekskoncentration (ng/µL → nM) | utspädning | CalcBEKonvertera bibliotekets masskoncentration till nM, kontrollera sedan utspädning och poolningsmål för sekvenseringsförberedelser.
- A260-kalkylator (DNA/RNA-koncentration och renhet) | CalcBEUppskatta nukleinsyrakoncentration och renhet från absorbans innan du konverterar till molära eller kopiebaserade enheter.
- Kalkylator för DNA-sammansättningsblandning (Gibson/Golden Gate) | CalcBEPlanera ryggrad och infoga mängder efter att du har konverterat dina lagerkoncentrationer till en jämförbar molär bas.
- qPCR-standardkurvaFörvandla antaganden om antal kopior till standardkurvor och planering av utspädningsserier för qPCR-körningar.
- Centrifugeomvandlare (rpm ↔ RCF ×g) | efter rotorradie | CalcBEKontrollera centrifuginställningarna tillsammans med provförberedande steg när du flyttar mellan koncentrations- och rengöringsarbetsflöden.
Feedback
Berätta för oss om problem eller förbättringsidéer för att förfina det här verktyget.