例題(プリセット)
例題を選ぶと入力が埋まり、すぐに結果が出ます。
入力
観測値(AA/Aa/aa)
df=2(p固定)を選んだときのみ使用します。
p指定(期待度数だけ)
このモードではχ²検定(p値)は計算しません。
アレル数(A, a)
このモードではχ²検定(p値)は計算しません。
上級(表示・グラフ)
貼り付け / CSV(任意)
TSV/CSVの貼り付けにも対応します(例:AA Aa aa)。貼り付けると入力欄に反映されます。
結果
—
※ これは統計計算ツールで、医学的判断のためのものではありません。
グラフ
※ 残差は観測値モードのみ表示します(上級→「残差を表示」)。
テーブル(O/E/寄与)
| genotype | observed(O) | expected(E) | O−E | (O−E)²/E | residual |
|---|
使い方・計算の考え方
- AA/Aa/aa を入力します(例題も使えます)。
- 自由度(既定はdf=1)と有意水準(表示用)を選びます。
- p,q、期待度数、χ²、p値が表示されます。
アレル頻度:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
期待度数(HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²:Σ (O−E)²/E(AA, Aa, aa の合計)
期待度数が小さい場合、χ²検定の近似が粗くなることがあります。警告表示を確認して使ってください。
よくある質問(FAQ)
ハーディ・ワインベルグ平衡(HWE)とは何ですか?
2アレル(A/a)で、ある仮定のもとではアレル頻度p,qからgenotypeの頻度が p²(AA), 2pq(Aa), q²(aa)になる、という考え方です。
pとqはどう計算していますか?
観測されたAA/Aa/aaから、p = (2*AA + Aa)/(2N), q = 1 - p で計算します。
χ²検定の自由度(df)はなぜ1が多いのですか?
観測値からpを推定しているため、3分類(AA/Aa/aa)では一般に df=1 がよく使われます(上級としてdf=2も選べます)。
期待度数が小さいと警告が出ました。どうすればいいですか?
期待度数が小さいとχ²検定の近似が粗くなることがあります。サンプル数やレンジを見直すか、厳密検定(exact test)も検討してください(本ツールでは未実装です)。
p値が小さい=必ず平衡ではない、ですか?
p値は“ずれの大きさ”を示す一つの目安です。サンプル数、集団の前提、データの取り方などでも変わるため、結果だけで断定しないのがおすすめです。
メンデル分離比のχ²検定と何が違いますか?
どちらも観測と期待を比べる点は同じですが、HWEはアレル頻度p,qから期待度数を作る点が特徴です。用途に応じて使い分けてください。
このツールの計算は外部に送信されますか?
送信されません。計算はブラウザ内で完結します。