← Biologi

Biokimia Pemasangan kurva

Kalkulator IC50/EC50 (sesuai kurva dosis–respons: 4PL/5PL)

Perkirakan IC50/EC50 (titik 50%) dari data konsentrasi-respons. Bandingkan 4PL vs 5PL, pilih penghambatan vs aktivasi, tampilkan mean±SD dan residu, kecualikan outlier, dan tinjau metrik kecocokan (R², RMSE, AIC).

Semua penghitungan dijalankan di browser Anda; data tidak terkirim.

Bahasa lain ja | en | zh-CN | es | pt-BR | id | fr | hi-IN | ar

Contoh (yang telah ditetapkan)

Pilih contoh untuk mengisi masukan dan segera melihat hasilnya.

Deskripsi
Cara menggunakan (3 langkah)
  1. Tempel konsentrasi dan respons (mendukung kolom replika) atau impor file CSV/TSV.
  2. Pilih arah (penghambatan/aktivasi) dan model (otomatis/4PL/5PL).
  3. IC50/EC50 (50% poin), kurva pas, dan metrik kecocokan ditampilkan.

Ini adalah alat analisis. Definisi 4PL/5PL dapat berbeda antar perangkat lunak. Periksa persamaan dan definisi “titik 50%”. Dalam 5PL, parameter infleksi mungkin berbeda dari titik 50%.

Masukan (tempel / CSV)

Format: kolom 1 = konsentrasi, kolom 2+ = respon (rep1, rep2,…). TSV/CSV didukung.

Pengecualian poin (opsional)
Dikecualikan
Tindakan

Pengaturan (minimal diperlukan)

Lanjutan (opsional)
Catatan
Dalam 5PL, parameter infleksi mungkin berbeda dari titik 50%. Lihat deskripsi di kartu hasil.

Hasil

gambar50(M)
Model
Arah
Poin (konsentrasi > 0)
RMSE
AIC / AICc / BIC / /
Perbandingan model (otomatis)

Plot

Untuk mengecualikan poin, aktifkan “Pengecualian poin” di bagian Input.

Tabel (rata-rata±SD, prediksi, residu)

Konsentrasi maksudnya SD kamu_hat tinggal Dikecualikan

Parameter

Barang Perkiraan 95% CI (bila diaktifkan)

CI 95% adalah perkiraan (linearisasi). Jangan terlalu percaya ketika Anda memiliki sedikit poin atau outlier. Dalam 5PL, poin 50% mungkin berbeda dari parameter infleksi EC50, jadi interpretasikan hasil dengan catatan di kartu hasil.

4PL/5PL dan poin 50%.

Alat ini menyesuaikan kurva dosis-respons dengan 4PL (simetris) atau 5PL (asimetris) dan menghitung titik tengah antara atas dan bawah (titik 50%) sebagai IC50/EC50.

Pemasangan menggunakan Levenberg – Marquardt (kuadrat terkecil nonlinier). Dengan pembobotan SD diaktifkan, setiap poin diberi bobot sebesar 1/SD2.

Persamaan (referensi)

Di sini, konsentrasi x positif.

  • 4PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50)^hill)
  • 5PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50_param)^hill)^asym

Di 5PL, EC50_param tidak selalu merupakan “titik 50%”. Alat ini menghitung poin 50% secara terpisah dan menampilkannya secara eksplisit.

Konsentrasi nol (kontrol) dapat membantu normalisasi, namun tidak dapat digunakan pada sumbu log x, jadi mengecualikannya dari pemasangan biasanya lebih aman.

FAQ

Apa perbedaan antara IC50 dan EC50?
Seringkali, IC50 digunakan untuk penghambatan (respon menurun dengan konsentrasi yang lebih tinggi) dan EC50 untuk aktivasi (respon meningkat). Alat ini menghitung titik 50% dan memberi label berdasarkan arah yang dipilih.
Apa perbedaan antara 4PL dan 5PL?
4PL mengasumsikan kurva sigmoidal simetris. 5PL dapat memodelkan sigmoid asimetris dan mungkin lebih cocok jika sisi kiri dan kanannya berbeda.
Apakah parameter 5PL EC50 sama dengan poin 50%?
Tidak selalu. Pada 5PL, parameter infleksi dapat berbeda dari titik tengah antara atas dan bawah. Alat ini menghitung dan menunjukkan titik 50% secara eksplisit.
Bisakah saya memasukkan konsentrasi nol (kontrol)?
Anda dapat menggunakannya untuk normalisasi, tetapi 0 tidak dapat digunakan pada sumbu log x. Mengecualikannya dari pemasangan biasanya lebih aman (alat ini mengikuti pendekatan tersebut).
Bagaimana cara menangani replika?
Kesesuaian menggunakan mean pada setiap konsentrasi. SD digunakan untuk bilah kesalahan, dan Anda dapat memberi bobot opsional sebesar 1/SD².
Bagaimana cara menghitung pIC50?
Jika satuan x Anda dapat diubah menjadi molar (M), pIC50 = -log10(IC50[M]). Untuk satuan konsentrasi massa (misalnya ng/mL), Anda dapat mengonversinya jika berat molekul diketahui.