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Biochimie Ajustement de courbe

Calculateur IC50/EC50 (ajustement de la courbe dose-réponse : 4PL/5PL)

Estimez IC50/EC50 (le point de 50 %) à partir des données concentration-réponse. Comparez 4PL et 5PL, choisissez inhibition ou activation, affichez la moyenne ± SD et les résidus, excluez les valeurs aberrantes et examinez les métriques d'ajustement (R², RMSE, AIC).

Tous les calculs s'exécutent dans votre navigateur ; les données ne sont pas envoyées.

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Exemple (préréglé)

Choisissez un exemple pour remplir les entrées et voir les résultats immédiatement.

Descriptif
—
Comment utiliser (3 étapes)
  1. Collez la concentration et la réponse (colonnes de réplication prises en charge) ou importez un fichier CSV/TSV.
  2. Sélectionnez la direction (inhibition/activation) et le modèle (auto/4PL/5PL).
  3. IC50/EC50 (point de 50 %), la courbe ajustée et les mesures d'ajustement sont affichées.

Il s'agit d'un outil d'analyse. Les définitions 4PL/5PL peuvent différer selon les logiciels. Vérifiez l’équation et la définition du « point 50 % ». En 5PL, le paramètre d'inflexion peut différer du point de 50 %.

Entrée (coller / CSV)

Format : col 1 = concentration, col 2+ = réponse (rep1, rep2, …). TSV/CSV pris en charge.

Exclusion de points (facultatif)
Exclus
—
Actions

Paramètres (minimum requis)

Avancé (facultatif)
Remarque
En 5PL, le paramètre d'inflexion peut différer du point de 50 %. Voir la description dans les fiches de résultats.

Résultats

—
—
pIC50（M）
—
Modèle—
Direction—
Points (conc > 0)—
R²—
RMSE—
AIC / AICc / BIC— / — / —
Comparaison de modèles (auto)—

Parcelles

Pour exclure des points, activez « Exclusion de points » dans la section Entrée.

Tableau (moyenne ± écart type, prédit, résidus)

Concentration signifier SD tu_chapeau résider Exclus

Paramètres

Article Estimation IC à 95 % (si activé)

L'IC à 95 % est une approximation (linéarisation). Ne lui faites pas trop confiance lorsque vous avez peu de points ou de valeurs aberrantes. En 5PL, le point de 50 % peut différer du paramètre d'inflexion EC50, alors interprétez les résultats avec les notes dans les fiches de résultats.

4PL/5PL et le point de 50%

Cet outil ajuste une courbe dose-réponse avec 4PL (symétrique) ou 5PL (asymétrique) et calcule le point médian entre le haut et le bas (le point de 50 %) comme IC50/EC50.

L'ajustement utilise Levenberg – Marquardt (moindres carrés non linéaires). Avec la pondération SD activée, chaque point est pondéré par 1/SD2.

Équations (référence)

Ici, concentration x est positif.

  • 4PL : y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50)^hill)
  • 5PL : y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50_param)^hill)^asym

En 5PL, EC50_param n'est pas toujours le « point de 50 % ». Cet outil calcule le point de 50 % séparément et l'affiche explicitement.

Une concentration nulle (contrôle) peut aider à la normalisation, mais elle ne peut pas être utilisée sur un axe logarithmique des x, il est donc généralement plus sûr de l'exclure de l'ajustement.

FAQ

Quelle est la différence entre IC50 et EC50 ?
Souvent, IC50 est utilisé pour l'inhibition (la réponse diminue avec une concentration plus élevée) et EC50 pour l'activation (la réponse augmente). Cet outil calcule le point de 50 % et l'étiquete en fonction de la direction sélectionnée.
Quelle est la différence entre 4PL et 5PL ?
4PL suppose une courbe sigmoïdale symétrique. 5PL peut modéliser des sigmoïdes asymétriques et peut mieux s'adapter lorsque les côtés gauche et droit diffèrent.
Le paramètre 5PL EC50 est-il le même que le point de 50 % ?
Pas toujours. En 5PL, le paramètre d'inflexion peut différer du point médian entre le haut et le bas. Cet outil calcule et affiche explicitement le point de 50 %.
Puis-je inclure une concentration nulle (contrôle) ?
Vous pouvez l'utiliser pour la normalisation, mais 0 ne peut pas être utilisé sur un axe x log. L’exclure de l’ajustement est généralement plus sûr (cet outil suit cette approche).
Comment sont gérées les répliques ?
L'ajustement utilise la moyenne à chaque concentration. SD est utilisé pour les barres d'erreur et vous pouvez éventuellement pondérer les points de 1/SD².
Comment est calculée la pIC50 ?
Si votre unité x peut être convertie en molaire (M), pIC50 = -log10(IC50[M]). Pour les unités de concentration massique (par exemple, ng/mL), vous pouvez convertir si le poids moléculaire est connu.