Exemple (préréglé)
Une fois que vous avez sélectionné un exemple, l'entrée sera renseignée et les résultats apparaîtront immédiatement.
entrée
Valeur observée (AA/Aa/aa)
Utilisé uniquement lorsque df=2 (p fixe) est sélectionné.
spécification p (uniquement la fréquence attendue)
Ce mode ne calcule pas le test χ² (valeur p).
Nombre d'allèles (A, a)
Ce mode ne calcule pas le test χ² (valeur p).
Avancé (affichage/graphique)
Coller / CSV (facultatif)
Il prend également en charge le collage de TSV/CSV (par ex.AA Aa aa). Une fois collé, il sera reflété dans le champ de saisie.
résultat
—
*Il s'agit d'un outil de calcul statistique et n'est pas destiné à un jugement médical.
graphique
*Les résidus sont affichés uniquement en mode valeur observée (Avancé → "Afficher les résidus").
Tableau (O/E/Contribution)
| génotype | observé(O) | attendu (E) | O-E | (O−E)²/E | résiduel |
|---|
Comment utiliser/calculer
- Saisissez AA/Aa/aa (vous pouvez également utiliser l'exemple).
- Sélectionnez les degrés de liberté (la valeur par défaut est df=1) et le niveau de signification (pour l'affichage).
- p,q, fréquence attendue, χ², valeur p sont affichés.
fréquence allélique:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
Fréquence attendue (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²: Σ (O−E)²/E (somme de AA, Aa, aa)
Si les fréquences attendues sont petites, le test χ² peut donner une mauvaise approximation. Veuillez vérifier l'affichage d'avertissement avant utilisation.
Questions fréquemment posées (FAQ)
Qu'est-ce que l'équilibre de Hardy-Weinberg (HWE) ?
L'idée est qu'avec 2 allèles (A/a), sous certaines hypothèses, les fréquences des génotypes seront p² (AA), 2pq (Aa), q² (aa) à partir des fréquences alléliques p et q.
Comment calcule-t-on p et q ?
À partir des AA/Aa/aa observés, calculez p = (2*AA + Aa)/(2N), q = 1 - p.
Pourquoi le degré de liberté (df) du test χ² est-il souvent égal à 1 ?
Puisque p est estimé à partir des valeurs observées, df=1 est généralement utilisé pour trois classifications (AA/Aa/aa) (df=2 peut également être sélectionné comme option avancée).
Un avertissement apparaissait si la fréquence attendue était faible. Que dois-je faire?
Si la fréquence attendue est petite, le test χ² peut donner une approximation grossière. Veuillez vérifier le nombre d'échantillons et la plage, ou envisager un test exact (non implémenté dans cet outil).
Petite valeur p = pas nécessairement d'équilibre, n'est-ce pas ?
La valeur p est une mesure de la « taille de l’écart ». Il est recommandé de ne pas tirer de conclusions basées uniquement sur les résultats, car ceux-ci varieront en fonction de la taille de l'échantillon, des hypothèses relatives à la population, de la méthode de collecte de données, etc.
Quelle est la différence avec le test χ² pour le rapport de séparation mendélien ?
Les deux méthodes sont similaires dans la mesure où elles comparent les observations et les attentes, mais HWE est unique dans la mesure où elle crée des fréquences attendues à partir des fréquences alléliques p et q. Veuillez les utiliser en fonction du but recherché.
Les calculs de cet outil sont-ils envoyés en externe ?
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