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遗传学 χ2检验

Hardy-Weinberg 平衡(定律)计算:预期频率/χ2

根据观察到的 AA/Aa/aa,共同计算等位基因频率 (p,q)、预期频率 (p²,2pq,q²)、χ2 和 p 值。您可以在图表和表格中检查观察结果与期望之间的差异。

所有计算均在浏览器内完成,不发送任何数据。

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示例(预设)

选择示例后,将填写输入内容并立即显示结果。

描述

输入

输入方式

观测值(AA/Aa/aa)

自由度 (df)
高级(显示/图形)

粘贴/CSV(可选)

它还支持粘贴 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。粘贴后,它将反映在输入字段中。

结果

N(总数)
p(A)
q(一)
MAF(参考)
χ²
df
p 值
判断(展示用)
霍布斯(观察异种)
Hep(预期异质)
F(参考)

*这是一个统计计算工具,不用于医学判断。

观察与期望
残差

*残差仅在观测值模式下显示(高级→“显示残差”)。

表(O/E/贡献)

基因型 观察到(O) 预期(E) OE (O−E)²/E 残差

如何使用/计算

  1. 输入 AA/Aa/aa(也可以使用示例)。
  2. 选择自由度(默认为 df=1)和显着性水平(用于显示)。
  3. 显示 p、q、预期频率、χ2、p 值。

等位基因频率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p

预期频率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N

χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)

如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出较差的近似值。使用前请检查警告显示。

常见问题

什么是哈迪-温伯格平衡 (HWE)?

这个想法是,对于 2 个等位基因 (A/a),在某些假设下,等位基因频率 p 和 q 的基因型频率将为 p² (AA)、2pq (Aa)、q² (aa)。

你如何计算p和q?

根据观察到的 AA/Aa/aa,计算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。

为什么 χ2 检验的自由度 (df) 通常等于 1?

由于p是根据观测值估计的,因此df=1一般用于三分类(AA/Aa/aa)(也可以选择df=2作为高级选项)。

如果预期频率较小,则会出现警告。我应该怎么办?

如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出粗略的近似值。请检查样本数量和范围,或考虑精确测试(此工具中未实现)。

小 p 值 = 不一定均衡,对吗?

p值是“偏差大小”的度量。建议您不要仅根据结果做出结论,因为这会根据样本大小、总体假设、数据收集方法等而有所不同。

与孟德尔分离比的 χ2 检验有什么区别?

两种方法的相似之处在于比较观察结果和预期,但 HWE 的独特之处在于它根据等位基因频率 p 和 q 创建预期频率。请根据用途使用。

该工具的计算结果是否发送到外部?

未发送。计算在浏览器内完成。