示例(预设)
选择示例后,将填写输入内容并立即显示结果。
输入
观测值(AA/Aa/aa)
仅当选择 df=2(p 固定)时使用。
p 规格(仅预期频率)
此模式不计算 χ2 检验(p 值)。
等位基因数 (A, a)
此模式不计算 χ2 检验(p 值)。
高级(显示/图形)
粘贴/CSV(可选)
它还支持粘贴 TSV/CSV (例如AA Aa aa)。粘贴后,它将反映在输入字段中。
结果
—
*这是一个统计计算工具,不用于医学判断。
图
*残差仅在观测值模式下显示(高级→“显示残差”)。
表(O/E/贡献)
| 基因型 | 观察到(O) | 预期(E) | OE | (O−E)²/E | 残差 |
|---|
如何使用/计算
- 输入 AA/Aa/aa(也可以使用示例)。
- 选择自由度(默认为 df=1)和显着性水平(用于显示)。
- 显示 p、q、预期频率、χ2、p 值。
等位基因频率:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p
预期频率 (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N
χ²:Σ (O−E)²/E(AA、Aa、aa 之和)
如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出较差的近似值。使用前请检查警告显示。
常见问题
什么是哈迪-温伯格平衡 (HWE)?
这个想法是,对于 2 个等位基因 (A/a),在某些假设下,等位基因频率 p 和 q 的基因型频率将为 p² (AA)、2pq (Aa)、q² (aa)。
你如何计算p和q?
根据观察到的 AA/Aa/aa,计算 p = (2*AA + Aa)/(2N),q = 1 - p。
为什么 χ2 检验的自由度 (df) 通常等于 1?
由于p是根据观测值估计的,因此df=1一般用于三分类(AA/Aa/aa)(也可以选择df=2作为高级选项)。
如果预期频率较小,则会出现警告。我应该怎么办?
如果预期频率很小,χ2 检验可能会给出粗略的近似值。请检查样本数量和范围,或考虑精确测试(此工具中未实现)。
小 p 值 = 不一定均衡,对吗?
p值是“偏差大小”的度量。建议您不要仅根据结果做出结论,因为这会根据样本大小、总体假设、数据收集方法等而有所不同。
与孟德尔分离比的 χ2 检验有什么区别?
两种方法的相似之处在于比较观察结果和预期,但 HWE 的独特之处在于它根据等位基因频率 p 和 q 创建预期频率。请根据用途使用。
该工具的计算结果是否发送到外部?
未发送。计算在浏览器内完成。