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genética teste χ²

Cálculo do equilíbrio de Hardy-Weinberg (lei): Frequência esperada/χ²

A partir do AA/Aa/aa observado, a frequência alélica (p,q), a frequência esperada (p²,2pq,q²), o valor de χ² e p são calculados coletivamente. Você pode verificar a diferença entre observações e expectativas em gráficos e tabelas.

Todos os cálculos são feitos no navegador e nenhum dado é enviado.

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Exemplo (predefinido)

Depois de selecionar um exemplo, a entrada será preenchida e os resultados aparecerão imediatamente.

Descrição

entrada

modo de entrada

Valor observado (AA/Aa/aa)

Graus de liberdade (df)
Avançado (exibição/gráfico)

Colar / CSV (opcional)

Ele também suporta colar TSV/CSV (por exemplo,AA Aa aa). Uma vez colado, ele será refletido no campo de entrada.

resultado

N (número total)
p(A)
q(um)
MAF (referência)
χ²
df
valor p
Julgamento (para exibição)
Hobs (observação hetero)
Hexp (hetero esperado)
F (referência)

*Esta é uma ferramenta de cálculo estatístico e não se destina ao julgamento médico.

gráfico

Observação vs Expectativa
residual

*Os resíduos são exibidos apenas no modo de valor observado (Avançado → "Mostrar resíduos").

Tabela (O/E/Contribuição)

genótipo observado (O) esperado (E) O-E (O−E)²/E residual

Como usar/calcular

  1. Insira AA/Aa/aa (você também pode usar o exemplo).
  2. Selecione graus de liberdade (o padrão é df=1) e nível de significância (para exibição).
  3. p,q, frequência esperada, χ², valor p são exibidos.

frequência alélica:p = (2·AA + Aa)/(2N), q = 1 − p

Frequência esperada (HWE):E(AA)=p²N, E(Aa)=2pqN, E(aa)=q²N

χ²: Σ (O−E)²/E (soma de AA, Aa, aa)

Se as frequências esperadas forem pequenas, o teste χ² pode fornecer uma aproximação fraca. Por favor, verifique a exibição de aviso antes de usar.

Perguntas frequentes (FAQ)

O que é o equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE)?

A ideia é que com 2 alelos (A/a), sob certas suposições, as frequências genotípicas serão p² (AA), 2pq (Aa), q² (aa) das frequências alélicas p e q.

Como você calcula p e q?

A partir do AA/Aa/aa observado, calcule p = (2*AA + Aa)/(2N), q = 1 - p.

Por que o grau de liberdade (df) do teste χ² é frequentemente igual a 1?

Como p é estimado a partir de valores observados, df=1 é geralmente usado para três classificações (AA/Aa/aa) (df=2 também pode ser selecionado como uma opção avançada).

Um aviso aparecia se a frequência esperada fosse pequena. O que devo fazer?

Se a frequência esperada for pequena, o teste χ² pode fornecer uma aproximação aproximada. Revise o número de amostras e o intervalo ou considere o teste exato (não implementado nesta ferramenta).

Valor p pequeno = não necessariamente equilíbrio, certo?

O valor p é uma medida do “tamanho do desvio”. Recomenda-se que não se tire conclusões apenas com base nos resultados, pois estes irão variar dependendo do tamanho da amostra, dos pressupostos populacionais, do método de recolha de dados, etc.

Qual é a diferença do teste χ² para a razão de separação mendeliana?

Ambos os métodos são semelhantes porque comparam observações e expectativas, mas o HWE é o único que cria frequências esperadas a partir das frequências alélicas p e q. Por favor, use-os dependendo da finalidade.

Os cálculos desta ferramenta são enviados externamente?

Não enviado. Os cálculos são concluídos no navegador.