← Biología

NGS Flujo de trabajo de laboratorio

NGS concentración de biblioteca: ng/μL → nM, dilución, combinación

Convierta la concentración de la biblioteca NGS de ng/μL y la longitud del fragmento (pb) a nM, luego calcule las diluciones de normalización y la combinación (volumen igual o molar igual). Admite tablas de muestras múltiples y copiar/exportar.

Todos los cálculos se ejecutan en su navegador. No se envían datos.

Otros idiomas ja | en | zh-CN | es | pt-BR | id | fr | hi-IN | ar

Cómo utilizar (3 pasos)

  1. Elija un ejemplo o ingrese la concentración de la biblioteca (ng/μL o nM) y la longitud del fragmento (pb).
  2. Seleccione un nM objetivo y un volumen final para ver una receta de dilución (caldo + agua).
  3. Elija un método de agrupación y revise los volúmenes por biblioteca y los nM agrupados (guía).

La conversión a nM depende de la longitud, los factores MW y el método de cuantificación. Trate los resultados como una guía y siga su protocolo para las decisiones finales.

Entradas (tabla de biblioteca)

Pegue directamente desde Excel/Hojas (separado por tabulaciones o comas). Columnas de ejemplo: nombre, ng por uL, longitud (bp), nM (los nombres de las columnas pueden variar).

Nombre Modo de entrada ng/μL Longitud (pb/nt) nM (entrada) Concentración (nM) Acciones

La tabla se desplaza horizontalmente (deslizar o arrastrar).

Tipo de molécula (ADNbc, etc.)

dsDNA (660 g/mol/pb) es una guía común para NGS. Los valores pueden variar según el método y la definición.

Normalización (diluir para igualar nM)

Agrupación

Resultados (conversión, dilución, combinación)

Nombre Existencias (nM) Dilución: stock (μL) Dilución: agua (μL) Volumen de la piscina (μL)

como se calcula

La conversión depende de la longitud, los factores MW y el método de cuantificación. Utilice estos resultados como guía.

Preguntas frecuentes

¿Para qué se utiliza la conversión ng/μL → nM?

Úselo para normalizar bibliotecas mediante recuentos de moléculas para agrupaciones de igual molar (diferentes de igual masa).

¿De dónde obtengo la longitud del fragmento (pb)?

Utilice el tamaño promedio de un informe de Bioanalyzer/TapeStation. Mantenga la inclusión del adaptador coherente con la definición del informe.

¿Cuál es la diferencia entre agrupación de igual masa y de igual molar?

Una masa igual coincide con los valores de ng, mientras que un molar igual coincide con los recuentos de moléculas (nM). Si las longitudes difieren, una masa igual no igualará el número de moléculas.

¿Qué es la normalización?

Normalice diluyendo todas las bibliotecas al mismo nM y luego agrupe volúmenes iguales. Esta herramienta proporciona ese flujo recomendado.

El volumen de dilución es demasiado pequeño (p. ej., 0,2 µL).

Es difícil pipetear volúmenes muy pequeños. Considere una dilución intermedia o ajustar el volumen final.

¿Puedo usar valores nM (o pM) de qPCR?

Sí. Utilice el modo de entrada directa nM. Tenga en cuenta que las definiciones de cuantificación pueden diferir según el método.

¿Será exacta la concentración combinada?

Es una guía. Los errores de cuantificación y pipeteo y la variación de la longitud de los fragmentos pueden alterar el valor final.

Comentarios

Informar problemas, solicitudes o casos de uso (los comentarios se cargan según demanda).