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分子生物学 克隆

DNA 装配混合计算器 (Gibson / Golden Gate)

根据 Gibson 或 Golden Gate 的主链/插入片段摩尔比计算所需的 DNA 质量和体积。如果提供了浓度,则计算总反应的体积和剩余水。

所有计算都在您的浏览器中运行。没有发送任何数据。

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使用方法(3步)

  1. 选择一个示例或输入主链和插入片段的片段长度 (bp) 和浓度 (ng/μL)。
  2. 选择摩尔比(例如,插入 2×)和主链量(pmol 或 ng)。
  3. 将显示所需的质量 (ng) 和体积 (μL),以及配方(主混合物/试剂和剩余的水)。

这是一个数量计算器。推荐的条件因试剂盒和方案而异,因此请遵循您的方案。 Golden Gate 试剂预设仅作为计算示例。

输入(片段表)

摩尔比反映分子计数。不同的长度意味着相同质量下的不同分子数。
详细信息(每个碱基对的分子量)
使用 660 g/mol/bp 作为 dsDNA 的近似值。
名称 角色 长度(bp) 浓度(纳克/微升) 行动
粘贴 TSV(可选)

从 Excel/表格粘贴(制表符分隔)。

结果

剩余水量 (µL)
总 DNA 体积 (µL)
总 DNA 质量 (ng)
2× 主混音 体积(微升)
片段 角色 长度(bp) 目标(pmol) 质量(纳克) 体积(微升) 注意事项

该工具仅计算金额。它并不能保证成功。

计算方法

  1. 作为 dsDNA 近似值, pmol =(质量ng×1000)/(bp×660).
  2. 设置主干量(pmol 为 Gibson,ng 为 Golden Gate)并计算主干 pmol。
  3. 每个插入目标是 insert_target_pmol =backbone_pmol × 比率,然后转换为质量 (ng)。
  4. 如果浓度 (ng/µL) 已知, 体积=质量/浓度 给出体积 (μL)。
  5. 剩余水的计算方法是总反应体积减去主混合物/试剂和 DNA 体积。

价值观是指导。按照您的试剂盒/方案了解最终条件。

常见问题

Gibson 和 Golden Gate 有什么区别?
两者都组装 DNA 片段,但反应机制和酶不同。该工具计算要混合多少 DNA。
为什么使用摩尔比?
不同长度的片段在相同质量下具有不同的分子数。摩尔比使分子计数保持一致。
常用的比例有哪些?
根据经验,插入物通常是主干的 2 倍或 3 倍。这取决于装配,应该进行测试。
我可以在没有浓度值的情况下使用它吗?
是的。您仍然可以计算所需的质量 (ng)。仅当提供浓度时才会显示体积 (μL)。
我的体积非常小(例如 0.1 µL)。
非常小的体积很容易出错。考虑中间稀释或调整骨架量和反应体积。
我可以按原样使用 Golden Gate 试剂预设吗?
试剂量取决于试剂盒和方案。预设仅作为计算示例;遵循您的协议。
这些金额能保证成功吗?
不可以。该工具仅计算金额。成功取决于设计、DNA 质量和反应条件。