الصفحة الرئيسية / العلوم والهندسة / علم الأحياء / IC50 / EC50

← علم الأحياء

الكيمياء الحيوية تركيب المنحنى

IC50/EC50 آلة حاسبة (تناسب منحنى الجرعة والاستجابة: 4PL/5PL)

قم بتقدير IC50/EC50 (نقطة 50%) من بيانات التركيز والاستجابة. قارن 4PL مقابل 5PL، واختر التثبيط مقابل التنشيط، وأظهر متوسط ​​±SD والبقايا، واستبعاد القيم المتطرفة، ومراجعة مقاييس الملاءمة (R²، RMSE، AIC).

يتم تشغيل جميع الحسابات في متصفحك؛ لا يتم إرسال البيانات.

لغات أخرى ja | en | zh-CN | es | pt-BR | id | fr | hi-IN | ar

مثال (مسبقا)

اختر مثالاً لملء المدخلات ورؤية النتائج على الفور.

الوصف
—
كيفية الاستخدام (3 خطوات)
  1. الصق التركيز والاستجابة (يدعم تكرار الأعمدة) أو قم باستيراد ملف CSV/TSV.
  2. حدد الاتجاه (التثبيط/التنشيط) والطراز (تلقائي/4PL/5PL).
  3. IC50/EC50 (نقطة 50%)، ويتم عرض المنحنى المجهز ومقاييس الملاءمة.

هذه هي أداة التحليل. يمكن أن تختلف تعريفات 4PL/5PL عبر البرامج. تحقق من المعادلة وتعريف "نقطة الـ 50%". في 5PL، قد تختلف معلمة الانعطاف عن نقطة 50%.

الإدخال (لصق / CSV)

التنسيق: العمود 1 = التركيز، العمود 2+ = الاستجابة (rep1، rep2، ...). TSV/CSV مدعوم.

استبعاد النقاط (اختياري)
مستبعد
—
الإجراءات

الإعدادات (الحد الأدنى المطلوب)

متقدم (اختياري)
ملاحظة
في 5PL، قد تختلف معلمة الانعطاف عن نقطة 50%. انظر الوصف في بطاقات النتائج.

النتائج

—
—
الموافقة المسبقة عن علم50 (م)
—
نموذج—
الاتجاه—
النقاط (موافقة > 0)—
ص²—
RMSE—
AIC / AICc / BIC— / — / —
مقارنة النماذج (تلقائي)—

المؤامرات

لاستبعاد النقاط، قم بتشغيل "استبعاد النقاط" في قسم الإدخال.

الجدول (يعني ± SD، المتوقع، المتبقي)

التركيز يعني SD y_hat يقيم مستبعد

المعلمات

البند تقدير 95% CI (عند التمكين)

95% CI هو تقريبي (خطي). لا تبالغ في الثقة به عندما يكون لديك القليل من النقاط أو القيم المتطرفة. في 5PL، قد تختلف نقطة 50% عن معلمة التصريف EC50، لذا قم بتفسير النتائج باستخدام الملاحظات الموجودة في بطاقات النتائج.

4PL/5PL ونقطة 50%

تناسب هذه الأداة منحنى الاستجابة للجرعة مع 4PL (متماثل) أو 5PL (غير متماثل) وتحسب نقطة الوسط بين الأعلى والأسفل (نقطة 50%) كـ IC50/EC50.

يستخدم التركيب Levenberg-Marquardt (المربعات الصغرى غير الخطية). مع تمكين وزن SD، يتم وزن كل نقطة بمقدار 1/SD2.

المعادلات (مرجع)

هنا التركيز x هو إيجابي.

  • 4PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50)^hill)
  • 5PL: y = bottom + (top-bottom) / (1 + (x/EC50_param)^hill)^asym

في 5PL، EC50_param ليست دائمًا "نقطة الـ 50%". تقوم هذه الأداة بحساب نقطة الـ 50% بشكل منفصل وتظهرها بشكل واضح.

يمكن أن يساعد التركيز الصفري (التحكم) في التطبيع، لكن لا يمكن استخدامه على سجل المحور السيني، لذا فإن استبعاده من التركيب عادة ما يكون أكثر أمانًا.

الأسئلة الشائعة

ما الفرق بين IC50 و EC50؟
في كثير من الأحيان، يتم استخدام IC50 للتثبيط (تقل الاستجابة مع زيادة التركيز) وEC50 للتنشيط (تزيد الاستجابة). تقوم هذه الأداة بحساب نقطة الـ 50% وتسميتها بناءً على الاتجاه المحدد.
ما هو الفرق بين 4PL و5PL؟
يفترض 4PL منحنى سيني متماثل. يمكن لـ 5PL أن يصمم السيني غير المتماثل وقد يتلاءم بشكل أفضل عندما يختلف الجانبان الأيسر والأيمن.
هل المعلمة 5PL EC50 هي نفس نقطة 50%؟
ليس دائما. في 5PL، يمكن أن تختلف معلمة الانعطاف عن نقطة المنتصف بين الأعلى والأسفل. تقوم هذه الأداة بحساب وإظهار نقطة الـ 50% بشكل صريح.
هل يمكنني تضمين التركيز الصفري (التحكم)؟
يمكنك استخدامه للتطبيع، ولكن لا يمكن استخدام 0 على المحور السيني للسجل. عادةً ما يكون استبعادها من التركيب أكثر أمانًا (تتبع هذه الأداة هذا النهج).
كيف يتم التعامل مع النسخ المتماثلة؟
يستخدم الملاءمة المتوسط عند كل تركيز. يتم استخدام SD لأشرطة الخطأ، ويمكنك اختياريًا وزن النقاط بمقدار 1/SD².
كيف يتم حساب pIC50؟
إذا كان من الممكن تحويل وحدة x إلى مولاري (M)، فإن pIC50 = -log10(IC50[M]). بالنسبة لوحدات التركيز الكتلي (على سبيل المثال، نانوغرام/مل)، يمكنك التحويل إذا كان الوزن الجزيئي معروفًا.