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PCR 分子生物学

底漆 Tm 计算器(PCR 退火温度指南)

从 DNA 序列(5'→3')计算引物 Tm 并估计 PCR 退火温度 (Ta)。在推荐的最近邻公式和简单公式之间切换,并输入正向/反向对。

所有计算都在您的浏览器中运行。没有发送任何数据。

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使用方法(3步)

  1. 选择一个示例或输入引物序列(正向/反向)。
  2. 如果需要,调整方法和条件(Na+、引物浓度)。
  3. 显示了 Tm 和退火温度指南 (Ta)。

Tm 和 Ta 是向导。最终条件取决于试剂、仪器和模板质量;如果需要,使用梯度 PCR 进行优化。

输入(引物序列)

计算方法

条件(可选)

Mg2+ / dNTP 仅在第 2 阶段进行注释(不用于计算)。

结果(Tm / Ta 指南)

使用方法
底漆 温度 长度 气相色谱%
前进
反向
方法比较(参考)
底漆 最近邻 盐调节 华莱士

当存在 IUPAC 基(N/R/Y 等)时,不应用最近邻。

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计算方法

如果存在 IUPAC 基(N/R/Y 等),则不应用最近邻法并使用简单方法。

常见问题

什么是Tm(熔化温度)?

Tm 是大约一半 DNA 双链体变性的温度。它取决于长度、GC% 和盐条件。

退火温度应该如何选择?

该工具显示 Ta(较低的 Tm 减去偏移量)作为指导。需要时使用梯度 PCR 进行优化。

为什么有多个公式?

不同的公式做出不同的假设。最近邻更详细;简单的公式和华莱士可以快速估算。

盐浓度会影响Tm吗?

是的。较高的盐通常可以稳定双链体并提高 Tm。

如果正向/反向 Tm 相差很大怎么办?

大的 ΔTm 表明更宽的温度范围(梯度 PCR)或重新设计引物。

我的序列被发送到任何地方吗?

不会。所有计算都在您的浏览器中运行,并且不会发送任何数据。

反馈意见

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