使用方法（3步）
- 选择一个示例或输入目标大小（基因组大小/总目标区域）。
- 输入读取计数 (PE/SE) 或总产量 (Gb)。
- 出现平均深度。如果需要，调整因子或使用逆计算。
这是一个估计。实际覆盖率并不统一，并且随重复、GC 偏差、设计和分析而变化。使用 QC 覆盖率分布进行验证。
输入
—
目标尺寸
WGS 使用基因组大小；外显子组/面板使用总目标大小 (bp)。
示例：3.2 Gb（约人类 WGS）/50 Mb（约人类外显子组）
输入方式
因数 (0–1)
您可以保留默认值进行粗略估计。
—
选项
≥k× 是基于 Poisson 的指南，假设均匀随机覆盖。实际数据会有所不同（在高深度，可以使用正态近似）。
结果（平均深度）
平均深度（×）
—
目标尺寸
—
输入方式
—
有效因子
—
逆（所需数据）
—
≥k×（指导）
—
中间计算（原始→可用→映射→目标→唯一）
| 步骤 | 基地（汽车单位） |
|---|
≥k×比例（指导）
| 阈值 | P(深度≥k) |
|---|
基于 Poisson 的指南，平均深度为 λ（由于覆盖范围不均匀，因此不确定）。
计算方法
- 根据读取计数 (PE/SE) 或总产量 (Gb) 计算 raw_bases。
- 应用可用率、映射率、目标值和重复率（1 个重复）来估计独特的目标碱基。
- 平均深度 = unique_on_target_bases / target_size。
- ≥k× 可以显示为基于 Poisson 的指南。
平均深度很有用，但均匀性是不同的。与覆盖率分布 QC 确认。
常见问题
30× WGS 需要多少次读取？
它取决于目标大小、读取长度和因素（映射率等）。根据您的条件使用逆计算。
达标率是多少？
落在目标区域的可用读数的粗略部分（因试剂盒/条件而异）。
如果平均深度相同，那么每个区域的深度是否相同？
不。平均值只是平均值，实际覆盖范围各不相同。以此作为指导。
≥k×比例准确吗？
这是一个基于 Poisson 的指南，假设均匀随机覆盖。实际数据有所不同。
相关工具
- DNA/RNA 浓度 ↔ 摩尔 ↔ 拷贝数
用于文库制备和输入转换。
- qPCR 标准曲线计算器
类似的定量工作流程（标准→曲线→反演）。
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