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qPCR 回帰

qPCR 標準曲線 計算機(効率・R²・未知量)

標準試料の量(コピー数/濃度など)と Ct から標準曲線を作成し、傾き・切片・R²・PCR 効率(%)を計算します。未知試料の Ct から量を逆算し、残差図・95%帯・手順ログ・CSV/LaTeX・共有URLにも対応します。

計算はすべてブラウザ内で行われ、データは送信されません。研究/教育目的でお使いください。

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使い方(3ステップ)

  1. 標準点(Quantity, Ct)を貼り付けるか CSV を読み込みます(同じ Quantity を複数行入れると反復として扱えます)。
  2. 推定法(OLS/WLS)や 95%帯などのオプションを選びます。未知試料の Ct があれば下に入力します。
  3. 「計算」を押すと、標準曲線・効率・品質チェック・未知量の推定・計算手順が表示されます。共有URLで同じ設定を共有できます。

おすすめの順番

  1. (まず)標準曲線を作る(このページ)
  2. (次に)PCR効率(%)を見る効率へ
  3. (必要なら)相対発現(ΔCt / ΔΔCt)を計算するΔCt / ΔΔCt

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データ入力とオプション

初期値は例題です。プリセットを入力すると標準点/未知/設定が上書きされます。自分のデータで使う場合は貼り付けて「計算」(または「リセット」)してください。結果(サマリ)へ

重み(WLS)のヒント

WLS は点ごとに重みを付けて当てはめます。1/Q1/Q² は、低濃度側の点の影響が相対的に大きくなります。w列 を使うと、点ごとに重みを直接指定できます。

結果(サマリ)

PCR効率(%)

標準曲線の傾き m から Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100 で計算します。ここで示す範囲は目安です。

ここに結果が表示されます。

表示の基準は「目安」です。研究/教育用途で、標準点や残差と合わせて確認してください。

品質チェック(目安)

濃度レベル(平均±SD)

Quantity log10Q n Ct_mean Ct_SD

標準点(回帰に使った点)

詳細列(weight / yhat / residual / leverage / cooksD)は折りたたみ表示できます。

Quantity log10Q Ct weight yhat residual leverage cooksD

未知試料(Ct → Quantity)

Sample Ct log10Q_hat Quantity_hat DF Quantity_corrected

標準曲線と残差図

標準曲線(Ct vs log10(Quantity))
このブラウザではグラフを表示できません。結果は表で確認してください。
点にカーソルを合わせると詳細が表示されます。
残差 vs 予測Ct
このブラウザではグラフを表示できません。結果は表で確認してください。
点にカーソルを合わせると詳細が表示されます。

計算の流れ(How it’s calculated)

    教師向けメモ

    FAQ

    qPCRの標準曲線とは何ですか?

    標準試料の量(コピー数/濃度など)とCtの関係を直線(Ct vs log10(量))で近似し、線形性(R²)や増幅効率の目安を確認するための曲線です。

    標準点は何点必要ですか?

    直線を引くには最低2点が必要です。線形性や外れ値を確認する目的では複数点(例: 4〜6点)を推奨します。

    PCR効率(%)はどのように計算しますか?

    標準曲線の傾き m から Efficiency = (10^(-1/m) - 1) × 100 で計算します。ここで示す範囲は「目安」です。

    slope が -3.32 付近だと何が分かりますか?

    一般に、10倍系列の標準曲線で slope が -3.32 付近だと、見かけの増幅効率が約100%に近い目安になります(理想状態の近似)。

    効率(%)が100%を超えることはありますか?

    傾きから推定する指標のため、希釈誤差や阻害などの影響で100%を超える見かけの値が出ることがあります。ここでは「目安」として扱い、残差や標準点を合わせて確認してください。

    共有URLにはデータも含まれますか?

    推定法や帯の設定など「設定」のみを保存します。標準点や未知試料のデータ本体は含まれません。

    Quantity の単位は何を入れればいいですか?

    コピー数、ng、濃度など任意です。Quantity は正の数である必要があります(log10 を取るため)。

    参考(出典メモ)

    ページ内の「目安」は一般的なガイドの例です。研究/教育用途として、必要に応じて一次情報も参照してください。

    コメント

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