كيفية الاستخدام (3 خطوات)
- حدد مثالاً أو أدخل تسلسلات التمهيدي (للأمام/للخلف).
- ضبط الأسلوب والشروط (Na+، تركيز التمهيدي) إذا لزم الأمر.
- يتم عرض Tm ودليل درجة حرارة التلدين (Ta).
Tm و Ta هما مرشدان. تعتمد الشروط النهائية على الكواشف، والصك، ونوعية القالب؛ قم بالتحسين باستخدام التدرج اللوني PCR إذا لزم الأمر.
المدخلات (تسلسلات التمهيدي)
النتائج (دليل Tm / Ta)
| التمهيدي | تم | الطول | نسبة GC |
|---|---|---|---|
| إلى الأمام | — | — | — |
| عكس | — | — | — |
مقارنة الطريقة (مرجع)
| التمهيدي | أقرب جار | تعديل الملح | والاس |
|---|
لا يتم تطبيق الجار الأقرب عند وجود قواعد IUPAC (N/R/Y، وما إلى ذلك).
مشاركة URL / تصدير
كيف يتم حسابها
- الموصى بها (أقرب جار): يجمع الديناميكا الحرارية للثنائي النوكليوتيد (ΔH/ΔS) ويطبق تصحيح Na+ وتركيز التمهيدي.
- أساسي (معدل بالملح): تقديرات Tm من GC%، والطول، وNa+.
- بسيط جدًا (والاس): تقدير تقريبي من أعداد A/T وG/C (الأفضل بالنسبة إلى القلة القصيرة).
- تا (دليل): انخفاض Tm ناقص الإزاحة (الافتراضي 3 درجات مئوية)، بالإضافة إلى النطاق المقترح (Ta ± 3 درجات مئوية).
في حالة وجود قواعد IUPAC (N/R/Y، وما إلى ذلك)، لا يتم تطبيق أقرب جار ويتم استخدام طريقة بسيطة.
الأسئلة الشائعة
ما هي Tm (درجة حرارة الانصهار)؟
Tm هي درجة الحرارة التي يتم عندها تغيير طبيعة نصف وحدة DNA المزدوجة تقريبًا. يعتمد ذلك على الطول ونسبة GC وظروف الملح.
كيف يجب أن أختار درجة حرارة التلدين؟
تعرض هذه الأداة Ta (أقل من Tm ناقص الإزاحة) كدليل. قم بالتحسين باستخدام التدرج PCR عند الحاجة.
لماذا هناك صيغ متعددة؟
الصيغ المختلفة تضع افتراضات مختلفة. الجار الأقرب أكثر تفصيلاً؛ الصيغ البسيطة والاس هي تقديرات سريعة.
هل يؤثر تركيز الملح على Tm؟
نعم. عادةً ما يعمل الملح العالي على تثبيت الدوبلكس ورفع Tm.
ماذا لو أن الأمام/الخلف Tm يختلف كثيرًا؟
يشير ΔTm الكبير إلى نطاق درجة حرارة أوسع (التدرج PCR) أو إعادة تصميم الاشعال.
هل يتم إرسال تسلسلاتي إلى أي مكان؟
لا، يتم تشغيل جميع الحسابات في متصفحك ولا يتم إرسال أي بيانات.
الأدوات ذات الصلة
ردود الفعل
إذا وجدت مشكلة أو تريد ميزة، فأخبرنا بذلك.