Cara menggunakan (3 langkah)
- Tempel data (Grup, Sampel, Ct_target, Ct_ref) atau muat CSV. Untuk beberapa referensi, gunakan Ct_ref1, Ct_ref2, ...
- Pilih grup kalibrator (atau sampel) dan metode ringkasan (rata-rata/median). Aktifkan koreksi Pfaffl jika diperlukan.
- Klik Hitung untuk menampilkan ΔCt/ΔΔCt, log2FC, dan lipat dalam tabel dan plot. Bagikan URL mempertahankan pengaturan yang sama.
Pesanan yang direkomendasikan
- Pertama, periksa efisiensi dengan kurva standar → qPCR kurva standar
- Selanjutnya menghitung ΔCt / ΔΔCt (halaman ini)
- Jika diperlukan, nilai variabilitas atau signifikansinya → Interval kepercayaan & uji hipotesis
Masuk lebih dalam
- Statistik deskriptif
Periksa distribusi dan outlier
- Regresi & korelasi linier
Memahami kurva standar
Masukan dan opsi data
Hasil (ringkasan)
Hasilnya akan muncul di sini.
Hasil per baris
| Baris | Kelompok | Sampel | Ct_target | Ct_ref | ΔCt | ΔΔCt | log2FC | lipat | Aneh |
|---|
Pencilan tidak dihapus secara otomatis; mereka ditampilkan sebagai kandidat (berbasis IQR).
Ringkasan grup
| Kelompok | n | log2FC berarti | log2FC SD | log2FC SEM | lipat rata-rata geometrik | lipat rata-rata aritmatika |
|---|
Plot (log2FC / lipat)
Langkah-langkah perhitungan (Cara menghitungnya)
FAQ
Apa perbedaan antara ΔCt dan ΔΔCt?
ΔCt adalah perbedaan dalam sampel antara target dan referensi. ΔΔCt adalah selisih relatif terhadap kalibrator.
Apa asumsi 2^-ΔΔCt?
Umumnya mengasumsikan efisiensi amplifikasi target dan referensi sama atau serupa. Gunakan koreksi Pfaffl jika berbeda.
Haruskah saya menggunakan lipat atau log2FC?
log2FC simetris dan lebih mudah untuk statistik dan plot. Lipatan lebih intuitif.
Bagaimana cara menangani beberapa gen referensi?
Ketika Ct_ref1, Ct_ref2, dll. disediakan, nilai referensi Ct dikumpulkan sebelum menghitung ΔCt.
Kapan saya harus menggunakan koreksi efisiensi Pfaffl?
Pertimbangkan koreksi Pfaffl ketika efisiensi target dan referensi berbeda secara substansial.
Apakah pembagian URL menyertakan data?
Hanya pengaturan yang disimpan; data tidak disertakan.
Alat terkait
Referensi (catatan)
Asumsi dan panduan pada halaman ini merupakan referensi umum. Untuk penelitian/pendidikan, konsultasikan dengan sumber primer bila diperlukan.
Komentar
Bagikan pertanyaan atau peningkatan (komentar dimuat setelah Anda mengklik tombol).