使い方（3ステップ）
- 例題を選ぶか、断片（Backbone/Insert）の長さ（bp）と濃度（ng/µL）を入力します。
- モル比（例：Insertを2×）と、Backboneの量（pmolまたはng）を選びます。
- 必要量（ng・µL）と、反応総量に合わせたレシピ（マスターミックス/試薬量と水の残量）が表示されます。
ここで行うのは“量の計算”です。試薬やプロトコルによって推奨条件は変わるため、最終判断は各手順に従ってください。Golden Gateの試薬量プリセットは計算用の例として用意しています。
入力（断片表）
結果（必要量とレシピ）
水（残量）
— µL
DNA合計体積（µL）
— µL
DNA合計量（ng）
— ng
マスターミックス/試薬量
— µL
| 断片 | 役割 | 長さ（bp） | 目標（pmol） | 量（ng） | 体積（µL） | メモ |
|---|
共有URLは入力を復元できます（英語固定キー）。
※ ここで行うのは“量の計算”です。反応成功を保証するものではありません。
計算の流れ（How it’s calculated）
- dsDNAの近似として、pmol = (mass_ng × 1000) / (bp × 660) を目安にします。
- Backboneの量を決め（Gibsonはpmol、Golden Gateはngがおすすめ）、Backboneのpmolを基準にします。
- 各Insertは、insert_target_pmol = backbone_pmol × ratio として目標pmolを決め、必要量（ng）へ換算します。
- 濃度（ng/µL）が分かる場合は volume = mass / conc で体積（µL）も計算します。
- 反応総量から、（Gibsonは2×Mix、Golden Gateは試薬量）とDNA体積を引いて水（残量）を計算します。
ここでの値は目安です。試薬/プロトコルによって推奨条件は変わるため、最終判断は各手順に従ってください。
よくある質問（FAQ）
GibsonとGolden Gateの違いは何ですか？
どちらもDNA断片を組み立てる方法ですが、反応の仕組みや使う酵素（試薬）が異なります。このツールは“断片をどれだけ混ぜるか（量）”を計算します。
なぜモル比で考えるのですか？
断片の長さが違うと、同じngでも分子数が違うためです。モル比でそろえると、条件を比べやすくなります。
よく使う比率はどれですか？
目安として、InsertをBackboneの2×や3×にすることが多いです。断片数や条件で変わるので、複数比率で試す前提が安全です。
濃度（ng/µL）が分からないときは使えますか？
使えます。必要量（ng）は計算できます。濃度が分かる場合だけ、必要体積（µL）も表示します。
0.1 µLなど体積が小さすぎます。
分注誤差が大きくなるため注意が必要です。中間希釈（いったん薄めてから分注）や、Backbone量/反応総量の見直しを検討してください。
Golden Gateの試薬量プリセットはそのまま使っていいですか？
プロトコルや試薬で推奨量が変わります。プリセットは計算の“例”として用意しているので、最終判断は手順に従ってください。
この結果どおりに入れれば必ず成功しますか？
いいえ。ここでは量を計算します。成功率は末端設計、DNA品質、反応条件などで変わります。